Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPC4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PPC4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A1W2PPC4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A1W2PPC4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A1W2PPC4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A1W2PPC4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A1W2PPC4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A1W2PPC4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A1W2PPC4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A1W2PPC4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A1W2PPC4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1W2PPC4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A1W2PPC4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A1W2PPC4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A1W2PPC4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A1W2PPC4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A1W2PPC4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A1W2PPC4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A1W2PPC4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A1W2PPC4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A1W2PPC4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A1W2PPC4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A1W2PPC4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A1W2PPC4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A1W2PPC4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A1W2PPC4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A1W2PPC4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A1W2PPC4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A1W2PPC4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A1W2PPC4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A1W2PPC4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms