Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GTW7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GTW7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A1B0GTW7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A1B0GTW7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A1B0GTW7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A1B0GTW7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
A0A1B0GTW7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A1B0GTW7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A1B0GTW7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A1B0GTW7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A1B0GTW7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A1B0GTW7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A1B0GTW7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A1B0GTW7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A1B0GTW7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A1B0GTW7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A1B0GTW7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A1B0GTW7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1B0GTW7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1B0GTW7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1B0GTW7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1B0GTW7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1B0GTW7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1B0GTW7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1B0GTW7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1B0GTW7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1B0GTW7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1B0GTW7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1B0GTW7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1B0GTW7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1B0GTW7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1B0GTW7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1B0GTW7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A1B0GTW7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A1B0GTW7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A1B0GTW7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
A0A1B0GTW7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1B0GTW7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1B0GTW7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1B0GTW7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1B0GTW7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1B0GTW7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1B0GTW7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1B0GTW7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1B0GTW7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1B0GTW7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1B0GTW7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1B0GTW7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1B0GTW7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1B0GTW7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1B0GTW7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1B0GTW7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1B0GTW7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1B0GTW7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1B0GTW7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1B0GTW7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1B0GTW7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1B0GTW7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1B0GTW7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1B0GTW7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1B0GTW7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1B0GTW7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1B0GTW7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1B0GTW7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1B0GTW7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1B0GTW7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1B0GTW7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1B0GTW7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1B0GTW7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1B0GTW7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1B0GTW7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1B0GTW7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1B0GTW7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1B0GTW7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1B0GTW7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1B0GTW7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1B0GTW7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1B0GTW7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1B0GTW7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1B0GTW7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1B0GTW7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1B0GTW7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1B0GTW7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1B0GTW7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1B0GTW7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1B0GTW7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1B0GTW7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1B0GTW7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1B0GTW7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1B0GTW7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1B0GTW7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1B0GTW7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1B0GTW7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1B0GTW7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1B0GTW7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1B0GTW7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1B0GTW7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1B0GTW7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1B0GTW7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1B0GTW7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1B0GTW7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms