Protein–RNA interactions for Protein: Q53H54

TRMT12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT12Q53H54 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRMT12Q53H54 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms