RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475304.5

TAPBP-238, Transcript of TAP binding protein, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TAPBP, Length 1,686 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TAPBP-238	ENST00000475304	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		39.25	■■■■□ 3.87
TAPBP-238	ENST00000475304	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		34.43	■■■■□ 3.1
TAPBP-238	ENST00000475304	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	32.99	■■■□□ 2.87
TAPBP-238	ENST00000475304	ABCC9	O60706	1549 aa		32.81	■■■□□ 2.84
TAPBP-238	ENST00000475304	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		32.62	■■■□□ 2.81
TAPBP-238	ENST00000475304	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		32.27	■■■□□ 2.76
TAPBP-238	ENST00000475304	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		32.15	■■■□□ 2.74
TAPBP-238	ENST00000475304	NACAD	O15069	1562 aa		32	■■■□□ 2.71
TAPBP-238	ENST00000475304	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		31.72	■■■□□ 2.67
TAPBP-238	ENST00000475304	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		31.7	■■■□□ 2.67
TAPBP-238	ENST00000475304	SCRIB	Q14160	1630 aa		31.4	■■■□□ 2.62
TAPBP-238	ENST00000475304	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		31.05	■■■□□ 2.56
TAPBP-238	ENST00000475304	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	30.63	■■■□□ 2.49
TAPBP-238	ENST00000475304	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		30.62	■■■□□ 2.49
TAPBP-238	ENST00000475304	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	30.56	■■■□□ 2.48
TAPBP-238	ENST00000475304	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	30.39	■■■□□ 2.45
TAPBP-238	ENST00000475304	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	30.37	■■■□□ 2.45
TAPBP-238	ENST00000475304	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		30.35	■■■□□ 2.45
TAPBP-238	ENST00000475304	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		30.3	■■■□□ 2.44
TAPBP-238	ENST00000475304	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		30.23	■■■□□ 2.43
TAPBP-238	ENST00000475304	SMARCA4	P51532	1647 aa		30.21	■■■□□ 2.43
TAPBP-238	ENST00000475304	WIZ	O95785	1651 aa		30.03	■■■□□ 2.4
TAPBP-238	ENST00000475304	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		29.92	■■■□□ 2.38
TAPBP-238	ENST00000475304	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	29.81	■■■□□ 2.36
TAPBP-238	ENST00000475304	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	29.78	■■■□□ 2.36
TAPBP-238	ENST00000475304	SMARCA2	P51531	1590 aa		29.76	■■■□□ 2.35
TAPBP-238	ENST00000475304	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		29.68	■■■□□ 2.34
TAPBP-238	ENST00000475304	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		29.64	■■■□□ 2.34
TAPBP-238	ENST00000475304	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	29.51	■■■□□ 2.31
TAPBP-238	ENST00000475304	HMGXB3	Q12766	1538 aa		29.48	■■■□□ 2.31
TAPBP-238	ENST00000475304	NCAPD3	P42695	1498 aa		29.44	■■■□□ 2.3
TAPBP-238	ENST00000475304	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		29.39	■■■□□ 2.3
TAPBP-238	ENST00000475304	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		29.34	■■■□□ 2.29
TAPBP-238	ENST00000475304	TRIM41	Q8WV44	630 aa		28.86	■■■□□ 2.21
TAPBP-238	ENST00000475304	PRDM2	Q13029	1718 aa		28.86	■■■□□ 2.21
TAPBP-238	ENST00000475304	CFTR	P13569	1480 aa		28.77	■■■□□ 2.2
TAPBP-238	ENST00000475304	ABCC8	Q09428	1581 aa		28.72	■■■□□ 2.19
TAPBP-238	ENST00000475304	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		28.64	■■■□□ 2.18
TAPBP-238	ENST00000475304	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	28.64	■■■□□ 2.18
TAPBP-238	ENST00000475304	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		28.53	■■■□□ 2.16
TAPBP-238	ENST00000475304	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		28.49	■■■□□ 2.15
TAPBP-238	ENST00000475304	SYNJ1	O43426	1573 aa		28.49	■■■□□ 2.15
TAPBP-238	ENST00000475304	TOP2B	Q02880	1626 aa		28.48	■■■□□ 2.15
TAPBP-238	ENST00000475304	EEA1	Q15075	1411 aa		28.39	■■■□□ 2.13
TAPBP-238	ENST00000475304	NES	P48681	1621 aa		28.35	■■■□□ 2.13
TAPBP-238	ENST00000475304	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		28.32	■■■□□ 2.12
TAPBP-238	ENST00000475304	CUX1	P39880	1505 aa		28.29	■■■□□ 2.12
TAPBP-238	ENST00000475304	ERCC6	Q03468	1493 aa		28.27	■■■□□ 2.12
TAPBP-238	ENST00000475304	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		28.24	■■■□□ 2.11
TAPBP-238	ENST00000475304	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		28.19	■■■□□ 2.1
TAPBP-238	ENST00000475304	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		28.15	■■■□□ 2.1
TAPBP-238	ENST00000475304	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	28.15	■■■□□ 2.1
TAPBP-238	ENST00000475304	SOGA1	O94964	1423 aa		28.15	■■■□□ 2.1
TAPBP-238	ENST00000475304	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		28.08	■■■□□ 2.09
TAPBP-238	ENST00000475304	CUX2	O14529	1486 aa		28.08	■■■□□ 2.09
TAPBP-238	ENST00000475304	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		28.08	■■■□□ 2.09
TAPBP-238	ENST00000475304	TOPBP1	Q92547	1522 aa		28.03	■■■□□ 2.08
TAPBP-238	ENST00000475304	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		28.03	■■■□□ 2.08
TAPBP-238	ENST00000475304	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		28.01	■■■□□ 2.07
TAPBP-238	ENST00000475304	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		28	■■■□□ 2.07
TAPBP-238	ENST00000475304	KIF21B	O75037	1637 aa		27.97	■■■□□ 2.07
TAPBP-238	ENST00000475304	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	27.96	■■■□□ 2.07
TAPBP-238	ENST00000475304	KIF27	Q86VH2	1401 aa		27.96	■■■□□ 2.07
TAPBP-238	ENST00000475304	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
TAPBP-238	ENST00000475304	GOLGA3	Q08378	1498 aa		27.89	■■■□□ 2.05
TAPBP-238	ENST00000475304	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
TAPBP-238	ENST00000475304	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TAPBP-238	ENST00000475304	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TAPBP-238	ENST00000475304	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TAPBP-238	ENST00000475304	WDR97	A6NE52	1622 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TAPBP-238	ENST00000475304	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TAPBP-238	ENST00000475304	WDR62	O43379	1518 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TAPBP-238	ENST00000475304	PRX	Q9BXM0	1461 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TAPBP-238	ENST00000475304	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TAPBP-238	ENST00000475304	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	27.64	■■■□□ 2.02
TAPBP-238	ENST00000475304	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
TAPBP-238	ENST00000475304	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		27.62	■■■□□ 2.01
TAPBP-238	ENST00000475304	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		27.62	■■■□□ 2.01
TAPBP-238	ENST00000475304	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		27.62	■■■□□ 2.01
TAPBP-238	ENST00000475304	CUL7	Q14999	1698 aa		27.62	■■■□□ 2.01
TAPBP-238	ENST00000475304	IGF1R	P08069	1367 aa		27.61	■■■□□ 2.01
TAPBP-238	ENST00000475304	CEP162	Q5TB80	1403 aa		27.57	■■■□□ 2
TAPBP-238	ENST00000475304	IFT140	Q96RY7	1462 aa		27.54	■■■□□ 2
TAPBP-238	ENST00000475304	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		27.51	■■□□□ 1.99
TAPBP-238	ENST00000475304	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		27.5	■■□□□ 1.99
TAPBP-238	ENST00000475304	PBRM1	Q86U86	1689 aa		27.45	■■□□□ 1.98
TAPBP-238	ENST00000475304	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		27.43	■■□□□ 1.98
TAPBP-238	ENST00000475304	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	27.39	■■□□□ 1.98
TAPBP-238	ENST00000475304	CLIP1	P30622	1438 aa		27.37	■■□□□ 1.97
TAPBP-238	ENST00000475304	GRIN2B	Q13224	1484 aa		27.32	■■□□□ 1.96
TAPBP-238	ENST00000475304	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		27.3	■■□□□ 1.96
TAPBP-238	ENST00000475304	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	27.27	■■□□□ 1.96
TAPBP-238	ENST00000475304	ADAMTS12	P58397	1594 aa		27.25	■■□□□ 1.95
TAPBP-238	ENST00000475304	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		27.24	■■□□□ 1.95
TAPBP-238	ENST00000475304	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	27.23	■■□□□ 1.95	7e-7	■■■■□ 20
TAPBP-238	ENST00000475304	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	27.21	■■□□□ 1.95
TAPBP-238	ENST00000475304	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		27.17	■■□□□ 1.94
TAPBP-238	ENST00000475304	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	27.14	■■□□□ 1.93
TAPBP-238	ENST00000475304	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		27.11	■■□□□ 1.93
TAPBP-238	ENST00000475304	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		27.09	■■□□□ 1.93

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