Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AUP1Q9Y679 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
AUP1Q9Y679 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AUP1Q9Y679 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AUP1Q9Y679 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AUP1Q9Y679 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AUP1Q9Y679 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AUP1Q9Y679 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AUP1Q9Y679 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AUP1Q9Y679 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AUP1Q9Y679 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AUP1Q9Y679 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
AUP1Q9Y679 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
AUP1Q9Y679 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AUP1Q9Y679 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AUP1Q9Y679 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AUP1Q9Y679 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AUP1Q9Y679 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AUP1Q9Y679 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AUP1Q9Y679 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AUP1Q9Y679 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
AUP1Q9Y679 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
AUP1Q9Y679 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AUP1Q9Y679 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AUP1Q9Y679 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
AUP1Q9Y679 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
AUP1Q9Y679 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
AUP1Q9Y679 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
AUP1Q9Y679 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AUP1Q9Y679 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AUP1Q9Y679 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
AUP1Q9Y679 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AUP1Q9Y679 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AUP1Q9Y679 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AUP1Q9Y679 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
AUP1Q9Y679 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AUP1Q9Y679 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
AUP1Q9Y679 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
AUP1Q9Y679 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
AUP1Q9Y679 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AUP1Q9Y679 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AUP1Q9Y679 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
AUP1Q9Y679 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AUP1Q9Y679 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
AUP1Q9Y679 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AUP1Q9Y679 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
AUP1Q9Y679 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
AUP1Q9Y679 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
AUP1Q9Y679 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AUP1Q9Y679 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AUP1Q9Y679 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AUP1Q9Y679 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AUP1Q9Y679 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
AUP1Q9Y679 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AUP1Q9Y679 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
AUP1Q9Y679 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
AUP1Q9Y679 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
AUP1Q9Y679 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AUP1Q9Y679 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AUP1Q9Y679 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AUP1Q9Y679 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AUP1Q9Y679 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AUP1Q9Y679 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
AUP1Q9Y679 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
AUP1Q9Y679 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
AUP1Q9Y679 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
AUP1Q9Y679 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AUP1Q9Y679 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
AUP1Q9Y679 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AUP1Q9Y679 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AUP1Q9Y679 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AUP1Q9Y679 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
AUP1Q9Y679 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AUP1Q9Y679 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AUP1Q9Y679 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AUP1Q9Y679 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AUP1Q9Y679 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AUP1Q9Y679 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AUP1Q9Y679 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AUP1Q9Y679 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AUP1Q9Y679 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AUP1Q9Y679 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
AUP1Q9Y679 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AUP1Q9Y679 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AUP1Q9Y679 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AUP1Q9Y679 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
AUP1Q9Y679 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
AUP1Q9Y679 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AUP1Q9Y679 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AUP1Q9Y679 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AUP1Q9Y679 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AUP1Q9Y679 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
AUP1Q9Y679 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AUP1Q9Y679 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
AUP1Q9Y679 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AUP1Q9Y679 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
AUP1Q9Y679 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
AUP1Q9Y679 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AUP1Q9Y679 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
AUP1Q9Y679 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms