Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLF12Q9Y4X4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
KLF12Q9Y4X4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
KLF12Q9Y4X4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLF12Q9Y4X4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLF12Q9Y4X4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLF12Q9Y4X4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLF12Q9Y4X4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLF12Q9Y4X4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLF12Q9Y4X4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLF12Q9Y4X4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLF12Q9Y4X4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLF12Q9Y4X4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLF12Q9Y4X4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLF12Q9Y4X4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLF12Q9Y4X4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLF12Q9Y4X4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLF12Q9Y4X4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLF12Q9Y4X4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLF12Q9Y4X4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLF12Q9Y4X4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF12Q9Y4X4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF12Q9Y4X4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF12Q9Y4X4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF12Q9Y4X4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF12Q9Y4X4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF12Q9Y4X4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF12Q9Y4X4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF12Q9Y4X4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF12Q9Y4X4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF12Q9Y4X4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF12Q9Y4X4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF12Q9Y4X4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF12Q9Y4X4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF12Q9Y4X4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF12Q9Y4X4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF12Q9Y4X4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF12Q9Y4X4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF12Q9Y4X4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF12Q9Y4X4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF12Q9Y4X4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF12Q9Y4X4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF12Q9Y4X4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF12Q9Y4X4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF12Q9Y4X4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF12Q9Y4X4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF12Q9Y4X4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF12Q9Y4X4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF12Q9Y4X4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF12Q9Y4X4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KLF12Q9Y4X4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
KLF12Q9Y4X4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF12Q9Y4X4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF12Q9Y4X4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF12Q9Y4X4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF12Q9Y4X4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF12Q9Y4X4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF12Q9Y4X4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF12Q9Y4X4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF12Q9Y4X4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF12Q9Y4X4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF12Q9Y4X4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF12Q9Y4X4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF12Q9Y4X4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF12Q9Y4X4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF12Q9Y4X4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF12Q9Y4X4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF12Q9Y4X4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF12Q9Y4X4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF12Q9Y4X4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF12Q9Y4X4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF12Q9Y4X4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF12Q9Y4X4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF12Q9Y4X4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF12Q9Y4X4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF12Q9Y4X4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF12Q9Y4X4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF12Q9Y4X4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF12Q9Y4X4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF12Q9Y4X4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF12Q9Y4X4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF12Q9Y4X4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF12Q9Y4X4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF12Q9Y4X4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF12Q9Y4X4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF12Q9Y4X4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF12Q9Y4X4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF12Q9Y4X4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF12Q9Y4X4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLF12Q9Y4X4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms