Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL51

HCN2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN2Q9UL51 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
HCN2Q9UL51 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HCN2Q9UL51 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HCN2Q9UL51 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HCN2Q9UL51 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HCN2Q9UL51 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HCN2Q9UL51 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HCN2Q9UL51 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HCN2Q9UL51 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HCN2Q9UL51 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HCN2Q9UL51 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HCN2Q9UL51 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HCN2Q9UL51 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HCN2Q9UL51 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HCN2Q9UL51 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HCN2Q9UL51 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HCN2Q9UL51 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HCN2Q9UL51 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HCN2Q9UL51 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HCN2Q9UL51 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HCN2Q9UL51 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HCN2Q9UL51 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HCN2Q9UL51 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HCN2Q9UL51 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HCN2Q9UL51 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HCN2Q9UL51 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HCN2Q9UL51 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HCN2Q9UL51 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HCN2Q9UL51 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HCN2Q9UL51 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HCN2Q9UL51 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HCN2Q9UL51 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HCN2Q9UL51 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HCN2Q9UL51 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HCN2Q9UL51 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HCN2Q9UL51 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HCN2Q9UL51 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HCN2Q9UL51 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HCN2Q9UL51 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HCN2Q9UL51 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HCN2Q9UL51 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HCN2Q9UL51 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HCN2Q9UL51 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HCN2Q9UL51 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HCN2Q9UL51 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HCN2Q9UL51 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HCN2Q9UL51 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HCN2Q9UL51 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HCN2Q9UL51 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HCN2Q9UL51 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HCN2Q9UL51 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HCN2Q9UL51 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HCN2Q9UL51 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HCN2Q9UL51 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HCN2Q9UL51 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HCN2Q9UL51 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HCN2Q9UL51 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HCN2Q9UL51 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HCN2Q9UL51 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HCN2Q9UL51 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HCN2Q9UL51 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HCN2Q9UL51 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HCN2Q9UL51 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HCN2Q9UL51 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HCN2Q9UL51 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HCN2Q9UL51 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HCN2Q9UL51 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HCN2Q9UL51 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HCN2Q9UL51 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HCN2Q9UL51 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HCN2Q9UL51 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HCN2Q9UL51 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HCN2Q9UL51 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HCN2Q9UL51 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HCN2Q9UL51 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HCN2Q9UL51 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HCN2Q9UL51 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HCN2Q9UL51 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HCN2Q9UL51 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HCN2Q9UL51 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HCN2Q9UL51 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HCN2Q9UL51 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HCN2Q9UL51 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HCN2Q9UL51 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HCN2Q9UL51 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HCN2Q9UL51 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HCN2Q9UL51 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HCN2Q9UL51 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HCN2Q9UL51 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HCN2Q9UL51 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HCN2Q9UL51 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HCN2Q9UL51 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HCN2Q9UL51 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HCN2Q9UL51 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HCN2Q9UL51 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HCN2Q9UL51 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HCN2Q9UL51 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HCN2Q9UL51 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HCN2Q9UL51 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HCN2Q9UL51 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms