Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCDH10Q9P2E7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCDH10Q9P2E7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCDH10Q9P2E7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCDH10Q9P2E7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCDH10Q9P2E7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCDH10Q9P2E7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCDH10Q9P2E7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PCDH10Q9P2E7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCDH10Q9P2E7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCDH10Q9P2E7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCDH10Q9P2E7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCDH10Q9P2E7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCDH10Q9P2E7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCDH10Q9P2E7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCDH10Q9P2E7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCDH10Q9P2E7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCDH10Q9P2E7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PCDH10Q9P2E7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCDH10Q9P2E7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PCDH10Q9P2E7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCDH10Q9P2E7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCDH10Q9P2E7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCDH10Q9P2E7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PCDH10Q9P2E7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCDH10Q9P2E7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PCDH10Q9P2E7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCDH10Q9P2E7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCDH10Q9P2E7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCDH10Q9P2E7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCDH10Q9P2E7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCDH10Q9P2E7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCDH10Q9P2E7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCDH10Q9P2E7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PCDH10Q9P2E7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PCDH10Q9P2E7 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCDH10Q9P2E7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PCDH10Q9P2E7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCDH10Q9P2E7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCDH10Q9P2E7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCDH10Q9P2E7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCDH10Q9P2E7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCDH10Q9P2E7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCDH10Q9P2E7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCDH10Q9P2E7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCDH10Q9P2E7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCDH10Q9P2E7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCDH10Q9P2E7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCDH10Q9P2E7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PCDH10Q9P2E7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCDH10Q9P2E7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCDH10Q9P2E7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCDH10Q9P2E7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCDH10Q9P2E7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCDH10Q9P2E7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCDH10Q9P2E7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCDH10Q9P2E7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCDH10Q9P2E7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCDH10Q9P2E7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCDH10Q9P2E7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCDH10Q9P2E7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCDH10Q9P2E7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCDH10Q9P2E7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PCDH10Q9P2E7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCDH10Q9P2E7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCDH10Q9P2E7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCDH10Q9P2E7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCDH10Q9P2E7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCDH10Q9P2E7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCDH10Q9P2E7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCDH10Q9P2E7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCDH10Q9P2E7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCDH10Q9P2E7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCDH10Q9P2E7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCDH10Q9P2E7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCDH10Q9P2E7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCDH10Q9P2E7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCDH10Q9P2E7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDH10Q9P2E7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDH10Q9P2E7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDH10Q9P2E7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDH10Q9P2E7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDH10Q9P2E7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDH10Q9P2E7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDH10Q9P2E7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDH10Q9P2E7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDH10Q9P2E7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCDH10Q9P2E7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCDH10Q9P2E7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCDH10Q9P2E7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCDH10Q9P2E7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCDH10Q9P2E7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCDH10Q9P2E7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCDH10Q9P2E7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCDH10Q9P2E7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCDH10Q9P2E7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCDH10Q9P2E7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCDH10Q9P2E7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCDH10Q9P2E7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCDH10Q9P2E7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms