Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNA2D2Q9NY47 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNA2D2Q9NY47 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNA2D2Q9NY47 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNA2D2Q9NY47 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNA2D2Q9NY47 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNA2D2Q9NY47 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNA2D2Q9NY47 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA2D2Q9NY47 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA2D2Q9NY47 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA2D2Q9NY47 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA2D2Q9NY47 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA2D2Q9NY47 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA2D2Q9NY47 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CACNA2D2Q9NY47 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CACNA2D2Q9NY47 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CACNA2D2Q9NY47 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CACNA2D2Q9NY47 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CACNA2D2Q9NY47 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CACNA2D2Q9NY47 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNA2D2Q9NY47 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNA2D2Q9NY47 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNA2D2Q9NY47 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNA2D2Q9NY47 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNA2D2Q9NY47 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNA2D2Q9NY47 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNA2D2Q9NY47 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNA2D2Q9NY47 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNA2D2Q9NY47 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNA2D2Q9NY47 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNA2D2Q9NY47 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNA2D2Q9NY47 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNA2D2Q9NY47 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNA2D2Q9NY47 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNA2D2Q9NY47 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA2D2Q9NY47 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA2D2Q9NY47 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA2D2Q9NY47 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA2D2Q9NY47 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA2D2Q9NY47 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA2D2Q9NY47 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CACNA2D2Q9NY47 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CACNA2D2Q9NY47 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CACNA2D2Q9NY47 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNA2D2Q9NY47 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNA2D2Q9NY47 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNA2D2Q9NY47 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNA2D2Q9NY47 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNA2D2Q9NY47 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNA2D2Q9NY47 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNA2D2Q9NY47 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNA2D2Q9NY47 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNA2D2Q9NY47 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNA2D2Q9NY47 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNA2D2Q9NY47 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNA2D2Q9NY47 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNA2D2Q9NY47 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNA2D2Q9NY47 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNA2D2Q9NY47 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA2D2Q9NY47 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA2D2Q9NY47 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA2D2Q9NY47 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA2D2Q9NY47 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA2D2Q9NY47 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA2D2Q9NY47 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA2D2Q9NY47 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA2D2Q9NY47 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNA2D2Q9NY47 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNA2D2Q9NY47 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNA2D2Q9NY47 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNA2D2Q9NY47 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNA2D2Q9NY47 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNA2D2Q9NY47 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNA2D2Q9NY47 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNA2D2Q9NY47 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNA2D2Q9NY47 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNA2D2Q9NY47 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CACNA2D2Q9NY47 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CACNA2D2Q9NY47 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA2D2Q9NY47 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA2D2Q9NY47 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA2D2Q9NY47 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA2D2Q9NY47 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA2D2Q9NY47 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA2D2Q9NY47 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA2D2Q9NY47 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNA2D2Q9NY47 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNA2D2Q9NY47 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNA2D2Q9NY47 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNA2D2Q9NY47 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNA2D2Q9NY47 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNA2D2Q9NY47 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNA2D2Q9NY47 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNA2D2Q9NY47 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNA2D2Q9NY47 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNA2D2Q9NY47 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNA2D2Q9NY47 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNA2D2Q9NY47 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA2D2Q9NY47 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA2D2Q9NY47 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms