Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 PHKA2-204ENST00000469645 728 ntTSL 518.77■□□□□ 0.62e-8■■■■■ 475.2
UTP3Q9NQZ2 PHKA2-206ENST00000473739 751 ntTSL 314.86□□□□□ -0.032e-8■■■■■ 475.2
UTP3Q9NQZ2 TES-204ENST00000455989 577 ntTSL 322.57■■□□□ 1.21e-25■■■■■ 475.1
UTP3Q9NQZ2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.071e-10■■■■■ 475.1
UTP3Q9NQZ2 TES-210ENST00000496871 961 ntTSL 1 (best)20.68■□□□□ 0.91e-25■■■■■ 475.1
UTP3Q9NQZ2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.71e-10■■■■■ 475.1
UTP3Q9NQZ2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.661e-25■■■■■ 475.1
UTP3Q9NQZ2 WDR25-205ENST00000554492 510 ntTSL 418.66■□□□□ 0.581e-10■■■■■ 475.1
UTP3Q9NQZ2 TES-208ENST00000492891 1022 ntTSL 218.62■□□□□ 0.571e-25■■■■■ 475.1
UTP3Q9NQZ2 WDR25-208ENST00000555775 705 ntTSL 517.14■□□□□ 0.331e-10■■■■■ 475.1
UTP3Q9NQZ2 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.181e-10■■■■■ 475.1
UTP3Q9NQZ2 TES-205ENST00000461440 873 ntTSL 215.56■□□□□ 0.081e-25■■■■■ 475.1
UTP3Q9NQZ2 SNAPC4-202ENST00000637388 1398 ntTSL 514.92□□□□□ -0.021e-25■■■■■ 475.1
UTP3Q9NQZ2 WDR25-206ENST00000554998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.251e-10■■■■■ 475.1
UTP3Q9NQZ2 NOLC1-202ENST00000405356 3967 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.98e-7■■■■■ 475
UTP3Q9NQZ2 NOLC1-209ENST00000605788 3932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.928e-7■■■■■ 475
UTP3Q9NQZ2 NOLC1-208ENST00000603946 3217 ntTSL 1 (best)9.06□□□□□ -0.968e-7■■■■■ 475
UTP3Q9NQZ2 NOLC1-201ENST00000370007 3727 ntTSL 1 (best)8.07□□□□□ -1.128e-7■■■■■ 475
UTP3Q9NQZ2 MBD5-230ENST00000637997 1602 ntTSL 58.42□□□□□ -1.064e-8■■■■■ 472.2
UTP3Q9NQZ2 TEX2-206ENST00000583738 458 ntTSL 313.36□□□□□ -0.276e-13■■■■■ 472
UTP3Q9NQZ2 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.531e-6■■■■■ 471.4
UTP3Q9NQZ2 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.191e-6■■■■■ 471.2
UTP3Q9NQZ2 SLC2A4RG-203ENST00000474248 624 ntTSL 224.17■■□□□ 1.461e-51■■■■■ 471
UTP3Q9NQZ2 NHSL2-205ENST00000631833 452 ntTSL 515.78■□□□□ 0.122e-10■■■■■ 468.2
UTP3Q9NQZ2 NHSL2-207ENST00000633930 13660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.512e-10■■■■■ 468.2
UTP3Q9NQZ2 SGSM2-204ENST00000572841 2450 ntTSL 217.47■□□□□ 0.395e-8■■■■■ 467.6
UTP3Q9NQZ2 SGSM2-206ENST00000572925 644 ntTSL 314.34□□□□□ -0.115e-8■■■■■ 467.6
UTP3Q9NQZ2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.139e-38■■■■■ 465.8
UTP3Q9NQZ2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.611e-28■■■■■ 465.8
UTP3Q9NQZ2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.849e-38■■■■■ 465.8
UTP3Q9NQZ2 GORASP1-212ENST00000452389 2933 ntTSL 1 (best)18.53■□□□□ 0.569e-38■■■■■ 465.8
UTP3Q9NQZ2 RHBDF1-204ENST00000428730 2751 ntTSL 517.53■□□□□ 0.43e-14■■■■■ 465.8
UTP3Q9NQZ2 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.291e-8■■■■■ 465.8
UTP3Q9NQZ2 GORASP1-211ENST00000441302 3240 ntTSL 216.76■□□□□ 0.279e-38■■■■■ 465.8
UTP3Q9NQZ2 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.181e-28■■■■■ 465.8
UTP3Q9NQZ2 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.099e-38■■■■■ 465.8
UTP3Q9NQZ2 ATP13A2-203ENST00000452699 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.11e-28■■■■■ 465.8
UTP3Q9NQZ2 GORASP1-213ENST00000453680 2873 ntTSL 1 (best)14.26□□□□□ -0.139e-38■■■■■ 465.8
UTP3Q9NQZ2 EIF1B-AS1-204ENST00000629217 553 ntTSL 413.06□□□□□ -0.321e-8■■■■■ 465.8
UTP3Q9NQZ2 TERF2-209ENST00000569280 513 ntTSL 510.04□□□□□ -0.89e-38■■■■■ 465.8
UTP3Q9NQZ2 TERF2-212ENST00000569611 556 ntTSL 49.64□□□□□ -0.879e-38■■■■■ 465.8
UTP3Q9NQZ2 TERF2-208ENST00000567841 554 ntTSL 49.3□□□□□ -0.929e-38■■■■■ 465.8
UTP3Q9NQZ2 PFKFB4-208ENST00000452531 1011 ntTSL 519.35■□□□□ 0.693e-7■■■■■ 464.5
UTP3Q9NQZ2 PFKFB4-206ENST00000422701 636 ntTSL 316.65■□□□□ 0.263e-7■■■■■ 464.5
UTP3Q9NQZ2 PFKFB4-215ENST00000496767 779 ntTSL 516.21■□□□□ 0.193e-7■■■■■ 464.5
UTP3Q9NQZ2 PFKFB4-203ENST00000412035 567 ntTSL 413.42□□□□□ -0.263e-7■■■■■ 464.5
UTP3Q9NQZ2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.436e-8■■■■■ 462.6
UTP3Q9NQZ2 PPP1R12C-209ENST00000592993 2269 ntTSL 1 (best)22.69■■□□□ 1.226e-8■■■■■ 462.6
UTP3Q9NQZ2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.936e-8■■■■■ 462.6
UTP3Q9NQZ2 SNAP47-206ENST00000470038 739 ntTSL 317.1■□□□□ 0.334e-7■■■■■ 461.9
UTP3Q9NQZ2 SNAP47-207ENST00000475930 792 ntTSL 314.51□□□□□ -0.094e-7■■■■■ 461.9
UTP3Q9NQZ2 SNAP47-211ENST00000491439 734 ntTSL 310.63□□□□□ -0.714e-7■■■■■ 461.9
UTP3Q9NQZ2 GALNT12-203ENST00000610463 550 ntTSL 419.82■□□□□ 0.763e-13■■■■■ 461.6
UTP3Q9NQZ2 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.33e-8■■■■■ 460.8
UTP3Q9NQZ2 NOL4L-209ENST00000485364 885 ntTSL 1 (best)25.39■■□□□ 1.661e-6■■■■■ 459.5
UTP3Q9NQZ2 RBM38-201ENST00000342690 852 ntTSL 323.51■■□□□ 1.354e-8■■■■■ 459.3
UTP3Q9NQZ2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.354e-8■■■■■ 459.3
UTP3Q9NQZ2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.354e-8■■■■■ 459.3
UTP3Q9NQZ2 RBM38-202ENST00000344785 2193 ntTSL 520.15■□□□□ 0.824e-8■■■■■ 459.3
UTP3Q9NQZ2 RUNX1-214ENST00000475045 1582 ntTSL 512.07□□□□□ -0.482e-9■■■■■ 458.9
UTP3Q9NQZ2 GRAMD4-205ENST00000447351 375 ntTSL 314.56□□□□□ -0.082e-6■■■■■ 457.4
UTP3Q9NQZ2 TTC7B-214ENST00000557292 864 ntTSL 315.96■□□□□ 0.151e-12■■■■■ 456.5
UTP3Q9NQZ2 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.321e-25■■■■■ 456.4
UTP3Q9NQZ2 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC6.36□□□□□ -1.391e-25■■■■■ 456.4
UTP3Q9NQZ2 METTL15-206ENST00000451385 1868 ntTSL 515.27■□□□□ 0.046e-7■■■■■ 454.4
UTP3Q9NQZ2 METTL15-212ENST00000634973 1353 ntTSL 513.66□□□□□ -0.226e-7■■■■■ 454.4
UTP3Q9NQZ2 METTL15-209ENST00000634627 1178 ntTSL 512.73□□□□□ -0.376e-7■■■■■ 454.4
UTP3Q9NQZ2 METTL15-203ENST00000406787 4304 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.426e-7■■■■■ 454.4
UTP3Q9NQZ2 METTL15-204ENST00000407364 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.836e-7■■■■■ 454.4
UTP3Q9NQZ2 METTL15-208ENST00000532947 1419 ntTSL 59.76□□□□□ -0.856e-7■■■■■ 454.4
UTP3Q9NQZ2 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.376e-7■■■■■ 454.4
UTP3Q9NQZ2 PAXIP1-204ENST00000457196 3990 ntTSL 523.05■■□□□ 1.281e-7■■■■■ 454
UTP3Q9NQZ2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.141e-7■■■■■ 454
UTP3Q9NQZ2 PAXIP1-201ENST00000397192 3711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.521e-7■■■■■ 454
UTP3Q9NQZ2 PAXIP1-206ENST00000473219 5515 ntTSL 511.3□□□□□ -0.61e-7■■■■■ 454
UTP3Q9NQZ2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.041e-20■■■■■ 453.4
UTP3Q9NQZ2 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.641e-20■■■■■ 453.4
UTP3Q9NQZ2 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.631e-20■■■■■ 453.4
UTP3Q9NQZ2 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.411e-20■■■■■ 453.4
UTP3Q9NQZ2 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.361e-20■■■■■ 453.4
UTP3Q9NQZ2 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.251e-20■■■■■ 453.4
UTP3Q9NQZ2 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.141e-20■■■■■ 453.4
UTP3Q9NQZ2 ASXL2-202ENST00000404843 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.72e-6■■■■■ 453.4
UTP3Q9NQZ2 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.136e-8■■■■■ 451
UTP3Q9NQZ2 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.126e-8■■■■■ 451
UTP3Q9NQZ2 PIGG-203ENST00000453061 3218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.236e-8■■■■■ 451
UTP3Q9NQZ2 PIGG-201ENST00000310340 3203 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.266e-8■■■■■ 451
UTP3Q9NQZ2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.135e-13■■■■■ 450.2
UTP3Q9NQZ2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.885e-13■■■■■ 450.2
UTP3Q9NQZ2 PPARGC1B-204ENST00000403750 3146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.364e-7■■■■■ 447.7
UTP3Q9NQZ2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.411e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 TPRA1-208ENST00000483868 1720 ntTSL 529.84■■■□□ 2.371e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 TPRA1-203ENST00000393400 1831 ntTSL 1 (best)29.59■■■□□ 2.331e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.221e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.211e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.071e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.071e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 KIFC3-209ENST00000562311 777 ntTSL 526.95■■□□□ 1.91e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 SLC25A30-205ENST00000522438 453 ntTSL 526.56■■□□□ 1.841e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.71e-18■■■■■ 447.2
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