Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB9

ACKR4, Atypical chemokine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR4Q9NPB9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACKR4Q9NPB9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACKR4Q9NPB9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACKR4Q9NPB9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACKR4Q9NPB9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACKR4Q9NPB9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACKR4Q9NPB9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACKR4Q9NPB9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACKR4Q9NPB9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACKR4Q9NPB9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACKR4Q9NPB9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACKR4Q9NPB9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACKR4Q9NPB9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ACKR4Q9NPB9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACKR4Q9NPB9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACKR4Q9NPB9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACKR4Q9NPB9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACKR4Q9NPB9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACKR4Q9NPB9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACKR4Q9NPB9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACKR4Q9NPB9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACKR4Q9NPB9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACKR4Q9NPB9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACKR4Q9NPB9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACKR4Q9NPB9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACKR4Q9NPB9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACKR4Q9NPB9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACKR4Q9NPB9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ACKR4Q9NPB9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACKR4Q9NPB9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACKR4Q9NPB9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ACKR4Q9NPB9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACKR4Q9NPB9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACKR4Q9NPB9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACKR4Q9NPB9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACKR4Q9NPB9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACKR4Q9NPB9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACKR4Q9NPB9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACKR4Q9NPB9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACKR4Q9NPB9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACKR4Q9NPB9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACKR4Q9NPB9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACKR4Q9NPB9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACKR4Q9NPB9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACKR4Q9NPB9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ACKR4Q9NPB9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACKR4Q9NPB9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACKR4Q9NPB9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACKR4Q9NPB9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACKR4Q9NPB9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ACKR4Q9NPB9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ACKR4Q9NPB9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACKR4Q9NPB9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACKR4Q9NPB9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACKR4Q9NPB9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACKR4Q9NPB9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACKR4Q9NPB9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACKR4Q9NPB9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACKR4Q9NPB9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACKR4Q9NPB9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACKR4Q9NPB9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACKR4Q9NPB9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACKR4Q9NPB9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACKR4Q9NPB9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACKR4Q9NPB9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACKR4Q9NPB9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACKR4Q9NPB9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACKR4Q9NPB9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACKR4Q9NPB9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACKR4Q9NPB9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACKR4Q9NPB9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ACKR4Q9NPB9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACKR4Q9NPB9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACKR4Q9NPB9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACKR4Q9NPB9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACKR4Q9NPB9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ACKR4Q9NPB9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ACKR4Q9NPB9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACKR4Q9NPB9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACKR4Q9NPB9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACKR4Q9NPB9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ACKR4Q9NPB9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACKR4Q9NPB9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACKR4Q9NPB9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACKR4Q9NPB9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACKR4Q9NPB9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACKR4Q9NPB9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACKR4Q9NPB9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACKR4Q9NPB9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACKR4Q9NPB9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACKR4Q9NPB9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACKR4Q9NPB9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACKR4Q9NPB9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACKR4Q9NPB9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACKR4Q9NPB9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACKR4Q9NPB9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACKR4Q9NPB9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACKR4Q9NPB9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACKR4Q9NPB9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACKR4Q9NPB9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms