Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EHD4Q9H223 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EHD4Q9H223 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EHD4Q9H223 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EHD4Q9H223 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EHD4Q9H223 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EHD4Q9H223 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EHD4Q9H223 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EHD4Q9H223 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
EHD4Q9H223 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EHD4Q9H223 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EHD4Q9H223 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
EHD4Q9H223 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
EHD4Q9H223 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EHD4Q9H223 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EHD4Q9H223 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EHD4Q9H223 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EHD4Q9H223 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EHD4Q9H223 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EHD4Q9H223 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EHD4Q9H223 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
EHD4Q9H223 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
EHD4Q9H223 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EHD4Q9H223 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EHD4Q9H223 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EHD4Q9H223 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EHD4Q9H223 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
EHD4Q9H223 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
EHD4Q9H223 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EHD4Q9H223 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
EHD4Q9H223 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EHD4Q9H223 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EHD4Q9H223 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
EHD4Q9H223 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EHD4Q9H223 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
EHD4Q9H223 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
EHD4Q9H223 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
EHD4Q9H223 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EHD4Q9H223 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
EHD4Q9H223 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EHD4Q9H223 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EHD4Q9H223 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EHD4Q9H223 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EHD4Q9H223 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
EHD4Q9H223 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EHD4Q9H223 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EHD4Q9H223 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EHD4Q9H223 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EHD4Q9H223 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EHD4Q9H223 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EHD4Q9H223 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EHD4Q9H223 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EHD4Q9H223 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EHD4Q9H223 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EHD4Q9H223 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
EHD4Q9H223 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
EHD4Q9H223 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EHD4Q9H223 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EHD4Q9H223 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EHD4Q9H223 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EHD4Q9H223 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EHD4Q9H223 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EHD4Q9H223 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EHD4Q9H223 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EHD4Q9H223 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EHD4Q9H223 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EHD4Q9H223 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EHD4Q9H223 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EHD4Q9H223 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EHD4Q9H223 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EHD4Q9H223 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EHD4Q9H223 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EHD4Q9H223 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EHD4Q9H223 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EHD4Q9H223 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EHD4Q9H223 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EHD4Q9H223 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EHD4Q9H223 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EHD4Q9H223 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
EHD4Q9H223 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EHD4Q9H223 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
EHD4Q9H223 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EHD4Q9H223 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EHD4Q9H223 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EHD4Q9H223 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EHD4Q9H223 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EHD4Q9H223 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EHD4Q9H223 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EHD4Q9H223 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EHD4Q9H223 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EHD4Q9H223 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EHD4Q9H223 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
EHD4Q9H223 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EHD4Q9H223 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EHD4Q9H223 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EHD4Q9H223 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EHD4Q9H223 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EHD4Q9H223 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
EHD4Q9H223 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
EHD4Q9H223 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms