Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM5

YIPF3, Protein YIPF3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF3Q9GZM5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YIPF3Q9GZM5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
YIPF3Q9GZM5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YIPF3Q9GZM5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YIPF3Q9GZM5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YIPF3Q9GZM5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YIPF3Q9GZM5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YIPF3Q9GZM5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YIPF3Q9GZM5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YIPF3Q9GZM5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
YIPF3Q9GZM5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
YIPF3Q9GZM5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YIPF3Q9GZM5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
YIPF3Q9GZM5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YIPF3Q9GZM5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
YIPF3Q9GZM5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YIPF3Q9GZM5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YIPF3Q9GZM5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YIPF3Q9GZM5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YIPF3Q9GZM5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YIPF3Q9GZM5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
YIPF3Q9GZM5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
YIPF3Q9GZM5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
YIPF3Q9GZM5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
YIPF3Q9GZM5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
YIPF3Q9GZM5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
YIPF3Q9GZM5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
YIPF3Q9GZM5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
YIPF3Q9GZM5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
YIPF3Q9GZM5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
YIPF3Q9GZM5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
YIPF3Q9GZM5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YIPF3Q9GZM5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
YIPF3Q9GZM5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
YIPF3Q9GZM5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YIPF3Q9GZM5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YIPF3Q9GZM5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
YIPF3Q9GZM5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YIPF3Q9GZM5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
YIPF3Q9GZM5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YIPF3Q9GZM5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YIPF3Q9GZM5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YIPF3Q9GZM5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YIPF3Q9GZM5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YIPF3Q9GZM5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YIPF3Q9GZM5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
YIPF3Q9GZM5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
YIPF3Q9GZM5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
YIPF3Q9GZM5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
YIPF3Q9GZM5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
YIPF3Q9GZM5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
YIPF3Q9GZM5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
YIPF3Q9GZM5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
YIPF3Q9GZM5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
YIPF3Q9GZM5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
YIPF3Q9GZM5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
YIPF3Q9GZM5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
YIPF3Q9GZM5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
YIPF3Q9GZM5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
YIPF3Q9GZM5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
YIPF3Q9GZM5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
YIPF3Q9GZM5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YIPF3Q9GZM5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YIPF3Q9GZM5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YIPF3Q9GZM5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YIPF3Q9GZM5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YIPF3Q9GZM5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YIPF3Q9GZM5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YIPF3Q9GZM5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YIPF3Q9GZM5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YIPF3Q9GZM5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YIPF3Q9GZM5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YIPF3Q9GZM5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YIPF3Q9GZM5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YIPF3Q9GZM5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YIPF3Q9GZM5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YIPF3Q9GZM5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YIPF3Q9GZM5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YIPF3Q9GZM5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
YIPF3Q9GZM5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YIPF3Q9GZM5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YIPF3Q9GZM5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YIPF3Q9GZM5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YIPF3Q9GZM5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YIPF3Q9GZM5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YIPF3Q9GZM5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YIPF3Q9GZM5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YIPF3Q9GZM5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YIPF3Q9GZM5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YIPF3Q9GZM5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
YIPF3Q9GZM5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
YIPF3Q9GZM5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YIPF3Q9GZM5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
YIPF3Q9GZM5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
YIPF3Q9GZM5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
YIPF3Q9GZM5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
YIPF3Q9GZM5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
YIPF3Q9GZM5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YIPF3Q9GZM5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YIPF3Q9GZM5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms