Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CELF4Q9BZC1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CELF4Q9BZC1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CELF4Q9BZC1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CELF4Q9BZC1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CELF4Q9BZC1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CELF4Q9BZC1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CELF4Q9BZC1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CELF4Q9BZC1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CELF4Q9BZC1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CELF4Q9BZC1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CELF4Q9BZC1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CELF4Q9BZC1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CELF4Q9BZC1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CELF4Q9BZC1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CELF4Q9BZC1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CELF4Q9BZC1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CELF4Q9BZC1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CELF4Q9BZC1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CELF4Q9BZC1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CELF4Q9BZC1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CELF4Q9BZC1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CELF4Q9BZC1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CELF4Q9BZC1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CELF4Q9BZC1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CELF4Q9BZC1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CELF4Q9BZC1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CELF4Q9BZC1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CELF4Q9BZC1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CELF4Q9BZC1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CELF4Q9BZC1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CELF4Q9BZC1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CELF4Q9BZC1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CELF4Q9BZC1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CELF4Q9BZC1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CELF4Q9BZC1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CELF4Q9BZC1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CELF4Q9BZC1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CELF4Q9BZC1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CELF4Q9BZC1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CELF4Q9BZC1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CELF4Q9BZC1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CELF4Q9BZC1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CELF4Q9BZC1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CELF4Q9BZC1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CELF4Q9BZC1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CELF4Q9BZC1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CELF4Q9BZC1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CELF4Q9BZC1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CELF4Q9BZC1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CELF4Q9BZC1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CELF4Q9BZC1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CELF4Q9BZC1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CELF4Q9BZC1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CELF4Q9BZC1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CELF4Q9BZC1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CELF4Q9BZC1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CELF4Q9BZC1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CELF4Q9BZC1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CELF4Q9BZC1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CELF4Q9BZC1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CELF4Q9BZC1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CELF4Q9BZC1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CELF4Q9BZC1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CELF4Q9BZC1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CELF4Q9BZC1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CELF4Q9BZC1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CELF4Q9BZC1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CELF4Q9BZC1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CELF4Q9BZC1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CELF4Q9BZC1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CELF4Q9BZC1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CELF4Q9BZC1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CELF4Q9BZC1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CELF4Q9BZC1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CELF4Q9BZC1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CELF4Q9BZC1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CELF4Q9BZC1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CELF4Q9BZC1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CELF4Q9BZC1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CELF4Q9BZC1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CELF4Q9BZC1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CELF4Q9BZC1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CELF4Q9BZC1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CELF4Q9BZC1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CELF4Q9BZC1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CELF4Q9BZC1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CELF4Q9BZC1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CELF4Q9BZC1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CELF4Q9BZC1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CELF4Q9BZC1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CELF4Q9BZC1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CELF4Q9BZC1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CELF4Q9BZC1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CELF4Q9BZC1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CELF4Q9BZC1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CELF4Q9BZC1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CELF4Q9BZC1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CELF4Q9BZC1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CELF4Q9BZC1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms