Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
PCGF6Q9BYE7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
PCGF6Q9BYE7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
PCGF6Q9BYE7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
PCGF6Q9BYE7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
PCGF6Q9BYE7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.62
PCGF6Q9BYE7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
PCGF6Q9BYE7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
PCGF6Q9BYE7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
PCGF6Q9BYE7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
PCGF6Q9BYE7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
PCGF6Q9BYE7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
PCGF6Q9BYE7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
PCGF6Q9BYE7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
PCGF6Q9BYE7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
PCGF6Q9BYE7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
PCGF6Q9BYE7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
PCGF6Q9BYE7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
PCGF6Q9BYE7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
PCGF6Q9BYE7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
PCGF6Q9BYE7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
PCGF6Q9BYE7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
PCGF6Q9BYE7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
PCGF6Q9BYE7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
PCGF6Q9BYE7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC37.58■■■■□ 3.61
PCGF6Q9BYE7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
PCGF6Q9BYE7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
PCGF6Q9BYE7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.61
PCGF6Q9BYE7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.61
PCGF6Q9BYE7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
PCGF6Q9BYE7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
PCGF6Q9BYE7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
PCGF6Q9BYE7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
PCGF6Q9BYE7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
PCGF6Q9BYE7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
PCGF6Q9BYE7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
PCGF6Q9BYE7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
PCGF6Q9BYE7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
PCGF6Q9BYE7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
PCGF6Q9BYE7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
PCGF6Q9BYE7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
PCGF6Q9BYE7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
PCGF6Q9BYE7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
PCGF6Q9BYE7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
PCGF6Q9BYE7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
PCGF6Q9BYE7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
PCGF6Q9BYE7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
PCGF6Q9BYE7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
PCGF6Q9BYE7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
PCGF6Q9BYE7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
PCGF6Q9BYE7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
PCGF6Q9BYE7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
PCGF6Q9BYE7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
PCGF6Q9BYE7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
PCGF6Q9BYE7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
PCGF6Q9BYE7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
PCGF6Q9BYE7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
PCGF6Q9BYE7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
PCGF6Q9BYE7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
PCGF6Q9BYE7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
PCGF6Q9BYE7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
PCGF6Q9BYE7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
PCGF6Q9BYE7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
PCGF6Q9BYE7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
PCGF6Q9BYE7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
PCGF6Q9BYE7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
PCGF6Q9BYE7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
PCGF6Q9BYE7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
PCGF6Q9BYE7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
PCGF6Q9BYE7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
PCGF6Q9BYE7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
PCGF6Q9BYE7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
PCGF6Q9BYE7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
PCGF6Q9BYE7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
PCGF6Q9BYE7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
PCGF6Q9BYE7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
PCGF6Q9BYE7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
PCGF6Q9BYE7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
PCGF6Q9BYE7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
PCGF6Q9BYE7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
PCGF6Q9BYE7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
PCGF6Q9BYE7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
PCGF6Q9BYE7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
PCGF6Q9BYE7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
PCGF6Q9BYE7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
PCGF6Q9BYE7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
PCGF6Q9BYE7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.58
PCGF6Q9BYE7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
PCGF6Q9BYE7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
PCGF6Q9BYE7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
PCGF6Q9BYE7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
PCGF6Q9BYE7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
PCGF6Q9BYE7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
PCGF6Q9BYE7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
PCGF6Q9BYE7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
PCGF6Q9BYE7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
PCGF6Q9BYE7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC37.42■■■■□ 3.58
PCGF6Q9BYE7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
PCGF6Q9BYE7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
PCGF6Q9BYE7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms