Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
VN1R3Q9BXE9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VN1R3Q9BXE9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VN1R3Q9BXE9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VN1R3Q9BXE9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VN1R3Q9BXE9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
VN1R3Q9BXE9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VN1R3Q9BXE9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
VN1R3Q9BXE9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
VN1R3Q9BXE9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VN1R3Q9BXE9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VN1R3Q9BXE9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VN1R3Q9BXE9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VN1R3Q9BXE9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VN1R3Q9BXE9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VN1R3Q9BXE9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VN1R3Q9BXE9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VN1R3Q9BXE9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VN1R3Q9BXE9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VN1R3Q9BXE9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VN1R3Q9BXE9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VN1R3Q9BXE9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VN1R3Q9BXE9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VN1R3Q9BXE9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VN1R3Q9BXE9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VN1R3Q9BXE9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VN1R3Q9BXE9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VN1R3Q9BXE9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VN1R3Q9BXE9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VN1R3Q9BXE9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
VN1R3Q9BXE9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
VN1R3Q9BXE9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VN1R3Q9BXE9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VN1R3Q9BXE9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VN1R3Q9BXE9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VN1R3Q9BXE9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VN1R3Q9BXE9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VN1R3Q9BXE9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VN1R3Q9BXE9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
VN1R3Q9BXE9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VN1R3Q9BXE9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
VN1R3Q9BXE9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VN1R3Q9BXE9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VN1R3Q9BXE9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VN1R3Q9BXE9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VN1R3Q9BXE9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VN1R3Q9BXE9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VN1R3Q9BXE9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VN1R3Q9BXE9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VN1R3Q9BXE9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VN1R3Q9BXE9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VN1R3Q9BXE9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VN1R3Q9BXE9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VN1R3Q9BXE9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VN1R3Q9BXE9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VN1R3Q9BXE9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VN1R3Q9BXE9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VN1R3Q9BXE9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VN1R3Q9BXE9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VN1R3Q9BXE9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VN1R3Q9BXE9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VN1R3Q9BXE9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VN1R3Q9BXE9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VN1R3Q9BXE9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VN1R3Q9BXE9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VN1R3Q9BXE9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VN1R3Q9BXE9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VN1R3Q9BXE9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VN1R3Q9BXE9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
VN1R3Q9BXE9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
VN1R3Q9BXE9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VN1R3Q9BXE9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VN1R3Q9BXE9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VN1R3Q9BXE9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VN1R3Q9BXE9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VN1R3Q9BXE9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
VN1R3Q9BXE9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
VN1R3Q9BXE9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
VN1R3Q9BXE9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VN1R3Q9BXE9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
VN1R3Q9BXE9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VN1R3Q9BXE9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VN1R3Q9BXE9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
VN1R3Q9BXE9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VN1R3Q9BXE9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VN1R3Q9BXE9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VN1R3Q9BXE9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VN1R3Q9BXE9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VN1R3Q9BXE9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VN1R3Q9BXE9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VN1R3Q9BXE9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VN1R3Q9BXE9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VN1R3Q9BXE9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VN1R3Q9BXE9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VN1R3Q9BXE9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
VN1R3Q9BXE9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VN1R3Q9BXE9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VN1R3Q9BXE9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VN1R3Q9BXE9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VN1R3Q9BXE9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms