Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD5

DEPDC7, DEP domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC7Q96QD5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DEPDC7Q96QD5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DEPDC7Q96QD5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DEPDC7Q96QD5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DEPDC7Q96QD5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DEPDC7Q96QD5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DEPDC7Q96QD5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DEPDC7Q96QD5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DEPDC7Q96QD5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DEPDC7Q96QD5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DEPDC7Q96QD5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DEPDC7Q96QD5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DEPDC7Q96QD5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DEPDC7Q96QD5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DEPDC7Q96QD5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DEPDC7Q96QD5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DEPDC7Q96QD5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DEPDC7Q96QD5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DEPDC7Q96QD5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DEPDC7Q96QD5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
DEPDC7Q96QD5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DEPDC7Q96QD5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DEPDC7Q96QD5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DEPDC7Q96QD5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
DEPDC7Q96QD5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DEPDC7Q96QD5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
DEPDC7Q96QD5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DEPDC7Q96QD5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DEPDC7Q96QD5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DEPDC7Q96QD5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DEPDC7Q96QD5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DEPDC7Q96QD5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DEPDC7Q96QD5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DEPDC7Q96QD5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DEPDC7Q96QD5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DEPDC7Q96QD5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DEPDC7Q96QD5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DEPDC7Q96QD5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DEPDC7Q96QD5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DEPDC7Q96QD5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DEPDC7Q96QD5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DEPDC7Q96QD5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DEPDC7Q96QD5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DEPDC7Q96QD5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DEPDC7Q96QD5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DEPDC7Q96QD5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DEPDC7Q96QD5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DEPDC7Q96QD5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
DEPDC7Q96QD5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DEPDC7Q96QD5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DEPDC7Q96QD5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DEPDC7Q96QD5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DEPDC7Q96QD5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DEPDC7Q96QD5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DEPDC7Q96QD5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DEPDC7Q96QD5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DEPDC7Q96QD5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DEPDC7Q96QD5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DEPDC7Q96QD5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DEPDC7Q96QD5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DEPDC7Q96QD5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DEPDC7Q96QD5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DEPDC7Q96QD5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DEPDC7Q96QD5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DEPDC7Q96QD5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DEPDC7Q96QD5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DEPDC7Q96QD5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DEPDC7Q96QD5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DEPDC7Q96QD5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DEPDC7Q96QD5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DEPDC7Q96QD5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DEPDC7Q96QD5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DEPDC7Q96QD5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DEPDC7Q96QD5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DEPDC7Q96QD5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DEPDC7Q96QD5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DEPDC7Q96QD5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DEPDC7Q96QD5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DEPDC7Q96QD5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DEPDC7Q96QD5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DEPDC7Q96QD5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DEPDC7Q96QD5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DEPDC7Q96QD5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DEPDC7Q96QD5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DEPDC7Q96QD5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DEPDC7Q96QD5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DEPDC7Q96QD5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DEPDC7Q96QD5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DEPDC7Q96QD5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DEPDC7Q96QD5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DEPDC7Q96QD5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DEPDC7Q96QD5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DEPDC7Q96QD5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DEPDC7Q96QD5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DEPDC7Q96QD5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DEPDC7Q96QD5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DEPDC7Q96QD5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DEPDC7Q96QD5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DEPDC7Q96QD5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DEPDC7Q96QD5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms