Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SENP8Q96LD8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SENP8Q96LD8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SENP8Q96LD8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SENP8Q96LD8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SENP8Q96LD8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SENP8Q96LD8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SENP8Q96LD8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SENP8Q96LD8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SENP8Q96LD8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SENP8Q96LD8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SENP8Q96LD8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SENP8Q96LD8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SENP8Q96LD8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SENP8Q96LD8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SENP8Q96LD8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SENP8Q96LD8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SENP8Q96LD8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SENP8Q96LD8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SENP8Q96LD8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SENP8Q96LD8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SENP8Q96LD8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SENP8Q96LD8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SENP8Q96LD8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SENP8Q96LD8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SENP8Q96LD8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SENP8Q96LD8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SENP8Q96LD8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SENP8Q96LD8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SENP8Q96LD8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SENP8Q96LD8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SENP8Q96LD8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SENP8Q96LD8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SENP8Q96LD8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SENP8Q96LD8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SENP8Q96LD8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SENP8Q96LD8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SENP8Q96LD8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SENP8Q96LD8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SENP8Q96LD8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SENP8Q96LD8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SENP8Q96LD8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SENP8Q96LD8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SENP8Q96LD8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SENP8Q96LD8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SENP8Q96LD8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SENP8Q96LD8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SENP8Q96LD8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SENP8Q96LD8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SENP8Q96LD8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SENP8Q96LD8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SENP8Q96LD8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SENP8Q96LD8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SENP8Q96LD8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SENP8Q96LD8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SENP8Q96LD8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SENP8Q96LD8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SENP8Q96LD8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SENP8Q96LD8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SENP8Q96LD8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SENP8Q96LD8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SENP8Q96LD8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SENP8Q96LD8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SENP8Q96LD8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SENP8Q96LD8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SENP8Q96LD8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SENP8Q96LD8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SENP8Q96LD8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SENP8Q96LD8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SENP8Q96LD8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SENP8Q96LD8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SENP8Q96LD8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SENP8Q96LD8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SENP8Q96LD8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SENP8Q96LD8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SENP8Q96LD8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SENP8Q96LD8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SENP8Q96LD8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SENP8Q96LD8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SENP8Q96LD8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SENP8Q96LD8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SENP8Q96LD8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SENP8Q96LD8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SENP8Q96LD8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SENP8Q96LD8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SENP8Q96LD8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SENP8Q96LD8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SENP8Q96LD8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SENP8Q96LD8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SENP8Q96LD8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SENP8Q96LD8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SENP8Q96LD8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SENP8Q96LD8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SENP8Q96LD8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SENP8Q96LD8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SENP8Q96LD8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SENP8Q96LD8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SENP8Q96LD8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SENP8Q96LD8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SENP8Q96LD8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.3 ms