Protein–RNA interactions for Protein: Q92572

AP3S1, AP-3 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S1Q92572 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3S1Q92572 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3S1Q92572 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3S1Q92572 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3S1Q92572 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3S1Q92572 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3S1Q92572 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3S1Q92572 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3S1Q92572 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3S1Q92572 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3S1Q92572 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3S1Q92572 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3S1Q92572 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP3S1Q92572 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP3S1Q92572 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP3S1Q92572 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP3S1Q92572 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP3S1Q92572 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP3S1Q92572 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP3S1Q92572 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP3S1Q92572 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP3S1Q92572 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP3S1Q92572 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP3S1Q92572 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3S1Q92572 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3S1Q92572 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3S1Q92572 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3S1Q92572 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3S1Q92572 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3S1Q92572 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3S1Q92572 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP3S1Q92572 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP3S1Q92572 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP3S1Q92572 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP3S1Q92572 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AP3S1Q92572 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
AP3S1Q92572 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP3S1Q92572 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP3S1Q92572 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP3S1Q92572 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP3S1Q92572 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP3S1Q92572 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AP3S1Q92572 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AP3S1Q92572 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AP3S1Q92572 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP3S1Q92572 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
AP3S1Q92572 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AP3S1Q92572 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP3S1Q92572 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP3S1Q92572 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP3S1Q92572 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP3S1Q92572 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP3S1Q92572 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP3S1Q92572 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP3S1Q92572 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AP3S1Q92572 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AP3S1Q92572 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP3S1Q92572 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP3S1Q92572 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP3S1Q92572 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP3S1Q92572 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AP3S1Q92572 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.29■■□□□ 1
AP3S1Q92572 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP3S1Q92572 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP3S1Q92572 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP3S1Q92572 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP3S1Q92572 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AP3S1Q92572 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AP3S1Q92572 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
AP3S1Q92572 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AP3S1Q92572 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AP3S1Q92572 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AP3S1Q92572 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AP3S1Q92572 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
AP3S1Q92572 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP3S1Q92572 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP3S1Q92572 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP3S1Q92572 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AP3S1Q92572 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AP3S1Q92572 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP3S1Q92572 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP3S1Q92572 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
AP3S1Q92572 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3S1Q92572 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3S1Q92572 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3S1Q92572 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3S1Q92572 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3S1Q92572 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3S1Q92572 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3S1Q92572 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3S1Q92572 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3S1Q92572 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3S1Q92572 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3S1Q92572 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3S1Q92572 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP3S1Q92572 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP3S1Q92572 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP3S1Q92572 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP3S1Q92572 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP3S1Q92572 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms