Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEJ3

SH3RF3, SH3 domain-containing RING finger protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF3Q8TEJ3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SH3RF3Q8TEJ3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SH3RF3Q8TEJ3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SH3RF3Q8TEJ3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SH3RF3Q8TEJ3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SH3RF3Q8TEJ3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SH3RF3Q8TEJ3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SH3RF3Q8TEJ3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SH3RF3Q8TEJ3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SH3RF3Q8TEJ3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SH3RF3Q8TEJ3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SH3RF3Q8TEJ3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SH3RF3Q8TEJ3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SH3RF3Q8TEJ3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SH3RF3Q8TEJ3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SH3RF3Q8TEJ3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SH3RF3Q8TEJ3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SH3RF3Q8TEJ3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SH3RF3Q8TEJ3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SH3RF3Q8TEJ3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SH3RF3Q8TEJ3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SH3RF3Q8TEJ3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SH3RF3Q8TEJ3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SH3RF3Q8TEJ3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SH3RF3Q8TEJ3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SH3RF3Q8TEJ3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SH3RF3Q8TEJ3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SH3RF3Q8TEJ3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SH3RF3Q8TEJ3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SH3RF3Q8TEJ3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SH3RF3Q8TEJ3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SH3RF3Q8TEJ3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SH3RF3Q8TEJ3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SH3RF3Q8TEJ3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SH3RF3Q8TEJ3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SH3RF3Q8TEJ3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SH3RF3Q8TEJ3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SH3RF3Q8TEJ3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SH3RF3Q8TEJ3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SH3RF3Q8TEJ3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SH3RF3Q8TEJ3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SH3RF3Q8TEJ3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SH3RF3Q8TEJ3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SH3RF3Q8TEJ3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SH3RF3Q8TEJ3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SH3RF3Q8TEJ3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SH3RF3Q8TEJ3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SH3RF3Q8TEJ3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SH3RF3Q8TEJ3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SH3RF3Q8TEJ3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SH3RF3Q8TEJ3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SH3RF3Q8TEJ3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SH3RF3Q8TEJ3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SH3RF3Q8TEJ3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SH3RF3Q8TEJ3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SH3RF3Q8TEJ3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SH3RF3Q8TEJ3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SH3RF3Q8TEJ3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SH3RF3Q8TEJ3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SH3RF3Q8TEJ3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SH3RF3Q8TEJ3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SH3RF3Q8TEJ3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SH3RF3Q8TEJ3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SH3RF3Q8TEJ3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SH3RF3Q8TEJ3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SH3RF3Q8TEJ3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SH3RF3Q8TEJ3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SH3RF3Q8TEJ3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SH3RF3Q8TEJ3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SH3RF3Q8TEJ3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SH3RF3Q8TEJ3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SH3RF3Q8TEJ3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SH3RF3Q8TEJ3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SH3RF3Q8TEJ3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SH3RF3Q8TEJ3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SH3RF3Q8TEJ3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SH3RF3Q8TEJ3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SH3RF3Q8TEJ3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SH3RF3Q8TEJ3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SH3RF3Q8TEJ3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SH3RF3Q8TEJ3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SH3RF3Q8TEJ3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SH3RF3Q8TEJ3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SH3RF3Q8TEJ3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SH3RF3Q8TEJ3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SH3RF3Q8TEJ3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SH3RF3Q8TEJ3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SH3RF3Q8TEJ3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SH3RF3Q8TEJ3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SH3RF3Q8TEJ3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SH3RF3Q8TEJ3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SH3RF3Q8TEJ3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SH3RF3Q8TEJ3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SH3RF3Q8TEJ3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SH3RF3Q8TEJ3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SH3RF3Q8TEJ3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155 ms