Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPC24Q8NBT2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPC24Q8NBT2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPC24Q8NBT2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPC24Q8NBT2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPC24Q8NBT2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPC24Q8NBT2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPC24Q8NBT2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPC24Q8NBT2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPC24Q8NBT2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SPC24Q8NBT2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPC24Q8NBT2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPC24Q8NBT2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SPC24Q8NBT2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SPC24Q8NBT2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SPC24Q8NBT2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SPC24Q8NBT2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SPC24Q8NBT2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPC24Q8NBT2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPC24Q8NBT2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPC24Q8NBT2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SPC24Q8NBT2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPC24Q8NBT2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPC24Q8NBT2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPC24Q8NBT2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPC24Q8NBT2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPC24Q8NBT2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPC24Q8NBT2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPC24Q8NBT2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPC24Q8NBT2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPC24Q8NBT2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPC24Q8NBT2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPC24Q8NBT2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPC24Q8NBT2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPC24Q8NBT2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPC24Q8NBT2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SPC24Q8NBT2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPC24Q8NBT2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPC24Q8NBT2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPC24Q8NBT2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPC24Q8NBT2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPC24Q8NBT2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPC24Q8NBT2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPC24Q8NBT2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPC24Q8NBT2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPC24Q8NBT2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPC24Q8NBT2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SPC24Q8NBT2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SPC24Q8NBT2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPC24Q8NBT2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPC24Q8NBT2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SPC24Q8NBT2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPC24Q8NBT2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPC24Q8NBT2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPC24Q8NBT2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPC24Q8NBT2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPC24Q8NBT2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPC24Q8NBT2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPC24Q8NBT2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPC24Q8NBT2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPC24Q8NBT2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPC24Q8NBT2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPC24Q8NBT2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPC24Q8NBT2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPC24Q8NBT2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPC24Q8NBT2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPC24Q8NBT2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPC24Q8NBT2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPC24Q8NBT2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPC24Q8NBT2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPC24Q8NBT2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPC24Q8NBT2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPC24Q8NBT2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPC24Q8NBT2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPC24Q8NBT2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPC24Q8NBT2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPC24Q8NBT2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPC24Q8NBT2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPC24Q8NBT2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPC24Q8NBT2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPC24Q8NBT2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SPC24Q8NBT2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SPC24Q8NBT2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPC24Q8NBT2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPC24Q8NBT2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPC24Q8NBT2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPC24Q8NBT2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPC24Q8NBT2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPC24Q8NBT2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SPC24Q8NBT2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPC24Q8NBT2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPC24Q8NBT2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPC24Q8NBT2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPC24Q8NBT2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPC24Q8NBT2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPC24Q8NBT2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPC24Q8NBT2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPC24Q8NBT2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPC24Q8NBT2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPC24Q8NBT2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.1 ms