Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA29

MFSD2A, Sodium-dependent lysophosphatidylcholine symporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD2AQ8NA29 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MFSD2AQ8NA29 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MFSD2AQ8NA29 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MFSD2AQ8NA29 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MFSD2AQ8NA29 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MFSD2AQ8NA29 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MFSD2AQ8NA29 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MFSD2AQ8NA29 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MFSD2AQ8NA29 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MFSD2AQ8NA29 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MFSD2AQ8NA29 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MFSD2AQ8NA29 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MFSD2AQ8NA29 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MFSD2AQ8NA29 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MFSD2AQ8NA29 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MFSD2AQ8NA29 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MFSD2AQ8NA29 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MFSD2AQ8NA29 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MFSD2AQ8NA29 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MFSD2AQ8NA29 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MFSD2AQ8NA29 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MFSD2AQ8NA29 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MFSD2AQ8NA29 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MFSD2AQ8NA29 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MFSD2AQ8NA29 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MFSD2AQ8NA29 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MFSD2AQ8NA29 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MFSD2AQ8NA29 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MFSD2AQ8NA29 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MFSD2AQ8NA29 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MFSD2AQ8NA29 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
MFSD2AQ8NA29 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MFSD2AQ8NA29 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MFSD2AQ8NA29 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MFSD2AQ8NA29 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MFSD2AQ8NA29 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MFSD2AQ8NA29 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MFSD2AQ8NA29 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MFSD2AQ8NA29 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MFSD2AQ8NA29 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MFSD2AQ8NA29 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MFSD2AQ8NA29 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MFSD2AQ8NA29 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MFSD2AQ8NA29 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MFSD2AQ8NA29 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MFSD2AQ8NA29 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MFSD2AQ8NA29 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MFSD2AQ8NA29 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MFSD2AQ8NA29 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MFSD2AQ8NA29 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MFSD2AQ8NA29 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MFSD2AQ8NA29 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MFSD2AQ8NA29 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MFSD2AQ8NA29 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MFSD2AQ8NA29 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MFSD2AQ8NA29 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MFSD2AQ8NA29 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MFSD2AQ8NA29 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MFSD2AQ8NA29 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MFSD2AQ8NA29 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MFSD2AQ8NA29 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MFSD2AQ8NA29 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MFSD2AQ8NA29 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MFSD2AQ8NA29 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MFSD2AQ8NA29 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MFSD2AQ8NA29 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MFSD2AQ8NA29 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MFSD2AQ8NA29 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MFSD2AQ8NA29 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MFSD2AQ8NA29 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MFSD2AQ8NA29 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MFSD2AQ8NA29 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MFSD2AQ8NA29 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MFSD2AQ8NA29 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MFSD2AQ8NA29 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MFSD2AQ8NA29 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MFSD2AQ8NA29 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MFSD2AQ8NA29 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MFSD2AQ8NA29 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MFSD2AQ8NA29 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MFSD2AQ8NA29 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MFSD2AQ8NA29 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MFSD2AQ8NA29 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MFSD2AQ8NA29 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MFSD2AQ8NA29 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MFSD2AQ8NA29 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MFSD2AQ8NA29 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MFSD2AQ8NA29 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MFSD2AQ8NA29 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MFSD2AQ8NA29 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MFSD2AQ8NA29 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MFSD2AQ8NA29 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MFSD2AQ8NA29 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MFSD2AQ8NA29 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MFSD2AQ8NA29 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MFSD2AQ8NA29 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MFSD2AQ8NA29 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MFSD2AQ8NA29 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MFSD2AQ8NA29 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MFSD2AQ8NA29 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms