Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1D0

SLC22A18AS, Beckwith-Wiedemann syndrome chromosomal region 1 candidate gene B protein, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A18ASQ8N1D0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC22A18ASQ8N1D0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC22A18ASQ8N1D0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC22A18ASQ8N1D0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC22A18ASQ8N1D0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC22A18ASQ8N1D0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC22A18ASQ8N1D0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC22A18ASQ8N1D0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC22A18ASQ8N1D0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC22A18ASQ8N1D0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC22A18ASQ8N1D0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC22A18ASQ8N1D0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC22A18ASQ8N1D0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC22A18ASQ8N1D0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC22A18ASQ8N1D0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC22A18ASQ8N1D0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC22A18ASQ8N1D0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC22A18ASQ8N1D0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC22A18ASQ8N1D0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC22A18ASQ8N1D0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC22A18ASQ8N1D0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC22A18ASQ8N1D0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC22A18ASQ8N1D0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC22A18ASQ8N1D0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC22A18ASQ8N1D0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC22A18ASQ8N1D0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC22A18ASQ8N1D0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC22A18ASQ8N1D0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC22A18ASQ8N1D0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC22A18ASQ8N1D0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC22A18ASQ8N1D0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC22A18ASQ8N1D0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC22A18ASQ8N1D0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC22A18ASQ8N1D0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC22A18ASQ8N1D0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC22A18ASQ8N1D0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC22A18ASQ8N1D0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC22A18ASQ8N1D0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC22A18ASQ8N1D0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC22A18ASQ8N1D0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC22A18ASQ8N1D0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC22A18ASQ8N1D0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC22A18ASQ8N1D0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC22A18ASQ8N1D0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC22A18ASQ8N1D0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC22A18ASQ8N1D0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC22A18ASQ8N1D0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC22A18ASQ8N1D0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC22A18ASQ8N1D0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC22A18ASQ8N1D0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC22A18ASQ8N1D0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC22A18ASQ8N1D0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC22A18ASQ8N1D0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC22A18ASQ8N1D0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC22A18ASQ8N1D0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC22A18ASQ8N1D0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC22A18ASQ8N1D0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC22A18ASQ8N1D0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC22A18ASQ8N1D0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC22A18ASQ8N1D0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC22A18ASQ8N1D0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC22A18ASQ8N1D0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC22A18ASQ8N1D0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC22A18ASQ8N1D0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC22A18ASQ8N1D0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC22A18ASQ8N1D0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC22A18ASQ8N1D0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC22A18ASQ8N1D0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC22A18ASQ8N1D0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC22A18ASQ8N1D0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC22A18ASQ8N1D0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC22A18ASQ8N1D0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC22A18ASQ8N1D0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC22A18ASQ8N1D0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC22A18ASQ8N1D0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC22A18ASQ8N1D0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC22A18ASQ8N1D0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC22A18ASQ8N1D0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC22A18ASQ8N1D0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC22A18ASQ8N1D0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC22A18ASQ8N1D0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC22A18ASQ8N1D0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC22A18ASQ8N1D0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC22A18ASQ8N1D0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC22A18ASQ8N1D0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC22A18ASQ8N1D0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC22A18ASQ8N1D0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC22A18ASQ8N1D0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC22A18ASQ8N1D0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC22A18ASQ8N1D0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC22A18ASQ8N1D0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC22A18ASQ8N1D0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC22A18ASQ8N1D0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC22A18ASQ8N1D0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC22A18ASQ8N1D0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC22A18ASQ8N1D0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC22A18ASQ8N1D0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC22A18ASQ8N1D0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC22A18ASQ8N1D0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC22A18ASQ8N1D0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms