Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC84Q86UT8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC84Q86UT8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC84Q86UT8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC84Q86UT8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC84Q86UT8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC84Q86UT8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC84Q86UT8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC84Q86UT8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC84Q86UT8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC84Q86UT8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC84Q86UT8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC84Q86UT8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC84Q86UT8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC84Q86UT8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC84Q86UT8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC84Q86UT8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC84Q86UT8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC84Q86UT8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC84Q86UT8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC84Q86UT8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC84Q86UT8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC84Q86UT8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC84Q86UT8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC84Q86UT8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC84Q86UT8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC84Q86UT8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC84Q86UT8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC84Q86UT8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC84Q86UT8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC84Q86UT8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC84Q86UT8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC84Q86UT8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC84Q86UT8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC84Q86UT8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC84Q86UT8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC84Q86UT8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC84Q86UT8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC84Q86UT8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC84Q86UT8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC84Q86UT8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC84Q86UT8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC84Q86UT8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC84Q86UT8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC84Q86UT8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC84Q86UT8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC84Q86UT8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC84Q86UT8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC84Q86UT8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC84Q86UT8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC84Q86UT8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC84Q86UT8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC84Q86UT8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC84Q86UT8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC84Q86UT8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC84Q86UT8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC84Q86UT8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC84Q86UT8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC84Q86UT8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC84Q86UT8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC84Q86UT8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC84Q86UT8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC84Q86UT8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC84Q86UT8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC84Q86UT8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC84Q86UT8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC84Q86UT8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC84Q86UT8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC84Q86UT8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC84Q86UT8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC84Q86UT8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC84Q86UT8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC84Q86UT8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC84Q86UT8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC84Q86UT8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC84Q86UT8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC84Q86UT8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC84Q86UT8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC84Q86UT8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC84Q86UT8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC84Q86UT8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC84Q86UT8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC84Q86UT8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC84Q86UT8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC84Q86UT8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC84Q86UT8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC84Q86UT8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC84Q86UT8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC84Q86UT8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC84Q86UT8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC84Q86UT8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC84Q86UT8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC84Q86UT8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC84Q86UT8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC84Q86UT8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC84Q86UT8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC84Q86UT8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC84Q86UT8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC84Q86UT8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC84Q86UT8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms