Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CTU1Q7Z7A3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CTU1Q7Z7A3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CTU1Q7Z7A3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CTU1Q7Z7A3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTU1Q7Z7A3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTU1Q7Z7A3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTU1Q7Z7A3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTU1Q7Z7A3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CTU1Q7Z7A3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTU1Q7Z7A3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTU1Q7Z7A3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTU1Q7Z7A3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTU1Q7Z7A3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTU1Q7Z7A3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTU1Q7Z7A3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTU1Q7Z7A3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTU1Q7Z7A3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTU1Q7Z7A3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTU1Q7Z7A3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CTU1Q7Z7A3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTU1Q7Z7A3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTU1Q7Z7A3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTU1Q7Z7A3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTU1Q7Z7A3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CTU1Q7Z7A3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTU1Q7Z7A3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTU1Q7Z7A3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CTU1Q7Z7A3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTU1Q7Z7A3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CTU1Q7Z7A3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CTU1Q7Z7A3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CTU1Q7Z7A3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CTU1Q7Z7A3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTU1Q7Z7A3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTU1Q7Z7A3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTU1Q7Z7A3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTU1Q7Z7A3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTU1Q7Z7A3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTU1Q7Z7A3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTU1Q7Z7A3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTU1Q7Z7A3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CTU1Q7Z7A3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTU1Q7Z7A3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CTU1Q7Z7A3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CTU1Q7Z7A3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTU1Q7Z7A3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTU1Q7Z7A3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTU1Q7Z7A3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CTU1Q7Z7A3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTU1Q7Z7A3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTU1Q7Z7A3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTU1Q7Z7A3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTU1Q7Z7A3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTU1Q7Z7A3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTU1Q7Z7A3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTU1Q7Z7A3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTU1Q7Z7A3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTU1Q7Z7A3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTU1Q7Z7A3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTU1Q7Z7A3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTU1Q7Z7A3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTU1Q7Z7A3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CTU1Q7Z7A3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CTU1Q7Z7A3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTU1Q7Z7A3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTU1Q7Z7A3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CTU1Q7Z7A3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTU1Q7Z7A3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTU1Q7Z7A3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTU1Q7Z7A3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTU1Q7Z7A3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTU1Q7Z7A3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CTU1Q7Z7A3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CTU1Q7Z7A3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTU1Q7Z7A3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTU1Q7Z7A3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTU1Q7Z7A3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTU1Q7Z7A3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTU1Q7Z7A3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTU1Q7Z7A3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTU1Q7Z7A3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTU1Q7Z7A3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTU1Q7Z7A3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CTU1Q7Z7A3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CTU1Q7Z7A3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTU1Q7Z7A3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTU1Q7Z7A3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTU1Q7Z7A3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTU1Q7Z7A3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTU1Q7Z7A3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTU1Q7Z7A3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTU1Q7Z7A3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CTU1Q7Z7A3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTU1Q7Z7A3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTU1Q7Z7A3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTU1Q7Z7A3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTU1Q7Z7A3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTU1Q7Z7A3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTU1Q7Z7A3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms