Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5L2

R3HCC1L, Coiled-coil domain-containing protein R3HCC1L, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1LQ7Z5L2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
R3HCC1LQ7Z5L2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
R3HCC1LQ7Z5L2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
R3HCC1LQ7Z5L2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
R3HCC1LQ7Z5L2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
R3HCC1LQ7Z5L2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
R3HCC1LQ7Z5L2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
R3HCC1LQ7Z5L2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
R3HCC1LQ7Z5L2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
R3HCC1LQ7Z5L2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
R3HCC1LQ7Z5L2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
R3HCC1LQ7Z5L2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
R3HCC1LQ7Z5L2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
R3HCC1LQ7Z5L2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
R3HCC1LQ7Z5L2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
R3HCC1LQ7Z5L2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
R3HCC1LQ7Z5L2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
R3HCC1LQ7Z5L2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
R3HCC1LQ7Z5L2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
R3HCC1LQ7Z5L2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
R3HCC1LQ7Z5L2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
R3HCC1LQ7Z5L2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
R3HCC1LQ7Z5L2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
R3HCC1LQ7Z5L2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
R3HCC1LQ7Z5L2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
R3HCC1LQ7Z5L2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
R3HCC1LQ7Z5L2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
R3HCC1LQ7Z5L2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
R3HCC1LQ7Z5L2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
R3HCC1LQ7Z5L2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
R3HCC1LQ7Z5L2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
R3HCC1LQ7Z5L2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
R3HCC1LQ7Z5L2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
R3HCC1LQ7Z5L2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
R3HCC1LQ7Z5L2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
R3HCC1LQ7Z5L2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
R3HCC1LQ7Z5L2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
R3HCC1LQ7Z5L2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
R3HCC1LQ7Z5L2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
R3HCC1LQ7Z5L2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
R3HCC1LQ7Z5L2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
R3HCC1LQ7Z5L2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
R3HCC1LQ7Z5L2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
R3HCC1LQ7Z5L2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
R3HCC1LQ7Z5L2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
R3HCC1LQ7Z5L2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
R3HCC1LQ7Z5L2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
R3HCC1LQ7Z5L2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
R3HCC1LQ7Z5L2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
R3HCC1LQ7Z5L2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
R3HCC1LQ7Z5L2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
R3HCC1LQ7Z5L2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
R3HCC1LQ7Z5L2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
R3HCC1LQ7Z5L2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
R3HCC1LQ7Z5L2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
R3HCC1LQ7Z5L2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
R3HCC1LQ7Z5L2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
R3HCC1LQ7Z5L2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
R3HCC1LQ7Z5L2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
R3HCC1LQ7Z5L2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
R3HCC1LQ7Z5L2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
R3HCC1LQ7Z5L2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
R3HCC1LQ7Z5L2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
R3HCC1LQ7Z5L2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
R3HCC1LQ7Z5L2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
R3HCC1LQ7Z5L2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HCC1LQ7Z5L2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HCC1LQ7Z5L2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HCC1LQ7Z5L2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HCC1LQ7Z5L2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3HCC1LQ7Z5L2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3HCC1LQ7Z5L2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3HCC1LQ7Z5L2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3HCC1LQ7Z5L2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3HCC1LQ7Z5L2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3HCC1LQ7Z5L2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3HCC1LQ7Z5L2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
R3HCC1LQ7Z5L2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HCC1LQ7Z5L2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HCC1LQ7Z5L2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HCC1LQ7Z5L2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HCC1LQ7Z5L2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HCC1LQ7Z5L2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HCC1LQ7Z5L2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HCC1LQ7Z5L2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HCC1LQ7Z5L2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HCC1LQ7Z5L2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
R3HCC1LQ7Z5L2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
R3HCC1LQ7Z5L2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
R3HCC1LQ7Z5L2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
R3HCC1LQ7Z5L2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
R3HCC1LQ7Z5L2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
R3HCC1LQ7Z5L2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
R3HCC1LQ7Z5L2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
R3HCC1LQ7Z5L2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
R3HCC1LQ7Z5L2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
R3HCC1LQ7Z5L2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
R3HCC1LQ7Z5L2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
R3HCC1LQ7Z5L2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
R3HCC1LQ7Z5L2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms