Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT6

SSX6, Putative protein SSX6, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX6Q7RTT6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSX6Q7RTT6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSX6Q7RTT6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSX6Q7RTT6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSX6Q7RTT6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSX6Q7RTT6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSX6Q7RTT6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSX6Q7RTT6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSX6Q7RTT6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSX6Q7RTT6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSX6Q7RTT6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSX6Q7RTT6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSX6Q7RTT6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSX6Q7RTT6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSX6Q7RTT6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSX6Q7RTT6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSX6Q7RTT6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSX6Q7RTT6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSX6Q7RTT6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSX6Q7RTT6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSX6Q7RTT6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSX6Q7RTT6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSX6Q7RTT6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSX6Q7RTT6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSX6Q7RTT6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSX6Q7RTT6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSX6Q7RTT6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSX6Q7RTT6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSX6Q7RTT6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSX6Q7RTT6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSX6Q7RTT6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSX6Q7RTT6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSX6Q7RTT6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSX6Q7RTT6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSX6Q7RTT6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSX6Q7RTT6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSX6Q7RTT6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSX6Q7RTT6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSX6Q7RTT6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSX6Q7RTT6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSX6Q7RTT6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSX6Q7RTT6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSX6Q7RTT6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSX6Q7RTT6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSX6Q7RTT6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSX6Q7RTT6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSX6Q7RTT6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSX6Q7RTT6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSX6Q7RTT6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSX6Q7RTT6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSX6Q7RTT6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSX6Q7RTT6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSX6Q7RTT6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSX6Q7RTT6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSX6Q7RTT6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SSX6Q7RTT6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSX6Q7RTT6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSX6Q7RTT6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSX6Q7RTT6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SSX6Q7RTT6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSX6Q7RTT6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSX6Q7RTT6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSX6Q7RTT6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSX6Q7RTT6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSX6Q7RTT6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSX6Q7RTT6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSX6Q7RTT6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSX6Q7RTT6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSX6Q7RTT6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSX6Q7RTT6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SSX6Q7RTT6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSX6Q7RTT6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SSX6Q7RTT6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSX6Q7RTT6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSX6Q7RTT6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSX6Q7RTT6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSX6Q7RTT6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSX6Q7RTT6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSX6Q7RTT6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSX6Q7RTT6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSX6Q7RTT6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSX6Q7RTT6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSX6Q7RTT6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSX6Q7RTT6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSX6Q7RTT6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSX6Q7RTT6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSX6Q7RTT6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSX6Q7RTT6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSX6Q7RTT6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSX6Q7RTT6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSX6Q7RTT6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SSX6Q7RTT6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSX6Q7RTT6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSX6Q7RTT6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSX6Q7RTT6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSX6Q7RTT6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSX6Q7RTT6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SSX6Q7RTT6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSX6Q7RTT6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSX6Q7RTT6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1826.1 ms