Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CASC2Q6XLA1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms