Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CSAG1Q6PB30 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
CSAG1Q6PB30 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CSAG1Q6PB30 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CSAG1Q6PB30 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CSAG1Q6PB30 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CSAG1Q6PB30 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CSAG1Q6PB30 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CSAG1Q6PB30 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CSAG1Q6PB30 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CSAG1Q6PB30 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CSAG1Q6PB30 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CSAG1Q6PB30 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CSAG1Q6PB30 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CSAG1Q6PB30 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CSAG1Q6PB30 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CSAG1Q6PB30 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CSAG1Q6PB30 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CSAG1Q6PB30 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CSAG1Q6PB30 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CSAG1Q6PB30 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CSAG1Q6PB30 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CSAG1Q6PB30 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CSAG1Q6PB30 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CSAG1Q6PB30 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CSAG1Q6PB30 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CSAG1Q6PB30 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CSAG1Q6PB30 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CSAG1Q6PB30 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CSAG1Q6PB30 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CSAG1Q6PB30 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CSAG1Q6PB30 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CSAG1Q6PB30 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CSAG1Q6PB30 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CSAG1Q6PB30 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
CSAG1Q6PB30 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CSAG1Q6PB30 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CSAG1Q6PB30 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CSAG1Q6PB30 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CSAG1Q6PB30 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CSAG1Q6PB30 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CSAG1Q6PB30 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CSAG1Q6PB30 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CSAG1Q6PB30 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CSAG1Q6PB30 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CSAG1Q6PB30 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CSAG1Q6PB30 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CSAG1Q6PB30 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CSAG1Q6PB30 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CSAG1Q6PB30 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
CSAG1Q6PB30 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
CSAG1Q6PB30 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms