Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE6

LCN10, Epididymal-specific lipocalin-10, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN10Q6JVE6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCN10Q6JVE6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LCN10Q6JVE6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LCN10Q6JVE6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LCN10Q6JVE6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCN10Q6JVE6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCN10Q6JVE6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCN10Q6JVE6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCN10Q6JVE6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LCN10Q6JVE6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCN10Q6JVE6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCN10Q6JVE6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCN10Q6JVE6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCN10Q6JVE6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCN10Q6JVE6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCN10Q6JVE6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCN10Q6JVE6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LCN10Q6JVE6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCN10Q6JVE6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCN10Q6JVE6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCN10Q6JVE6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCN10Q6JVE6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCN10Q6JVE6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCN10Q6JVE6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCN10Q6JVE6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCN10Q6JVE6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCN10Q6JVE6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LCN10Q6JVE6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCN10Q6JVE6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCN10Q6JVE6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCN10Q6JVE6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCN10Q6JVE6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LCN10Q6JVE6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCN10Q6JVE6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCN10Q6JVE6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCN10Q6JVE6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCN10Q6JVE6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCN10Q6JVE6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCN10Q6JVE6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCN10Q6JVE6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LCN10Q6JVE6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
LCN10Q6JVE6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LCN10Q6JVE6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LCN10Q6JVE6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LCN10Q6JVE6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCN10Q6JVE6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCN10Q6JVE6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCN10Q6JVE6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCN10Q6JVE6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCN10Q6JVE6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCN10Q6JVE6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LCN10Q6JVE6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCN10Q6JVE6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCN10Q6JVE6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCN10Q6JVE6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCN10Q6JVE6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LCN10Q6JVE6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCN10Q6JVE6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCN10Q6JVE6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCN10Q6JVE6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCN10Q6JVE6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCN10Q6JVE6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LCN10Q6JVE6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCN10Q6JVE6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCN10Q6JVE6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCN10Q6JVE6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCN10Q6JVE6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCN10Q6JVE6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCN10Q6JVE6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCN10Q6JVE6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCN10Q6JVE6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCN10Q6JVE6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCN10Q6JVE6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LCN10Q6JVE6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCN10Q6JVE6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCN10Q6JVE6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCN10Q6JVE6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCN10Q6JVE6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCN10Q6JVE6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCN10Q6JVE6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCN10Q6JVE6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCN10Q6JVE6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCN10Q6JVE6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCN10Q6JVE6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCN10Q6JVE6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCN10Q6JVE6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCN10Q6JVE6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCN10Q6JVE6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCN10Q6JVE6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCN10Q6JVE6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCN10Q6JVE6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCN10Q6JVE6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCN10Q6JVE6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCN10Q6JVE6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCN10Q6JVE6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCN10Q6JVE6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCN10Q6JVE6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCN10Q6JVE6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCN10Q6JVE6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCN10Q6JVE6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms