Protein–RNA interactions for Protein: Q6IEG0

SNRNP48, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 48 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP48Q6IEG0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SNRNP48Q6IEG0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SNRNP48Q6IEG0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SNRNP48Q6IEG0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SNRNP48Q6IEG0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SNRNP48Q6IEG0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SNRNP48Q6IEG0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SNRNP48Q6IEG0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SNRNP48Q6IEG0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SNRNP48Q6IEG0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SNRNP48Q6IEG0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNRNP48Q6IEG0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNRNP48Q6IEG0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNRNP48Q6IEG0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNRNP48Q6IEG0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SNRNP48Q6IEG0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SNRNP48Q6IEG0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SNRNP48Q6IEG0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SNRNP48Q6IEG0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SNRNP48Q6IEG0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SNRNP48Q6IEG0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SNRNP48Q6IEG0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNRNP48Q6IEG0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNRNP48Q6IEG0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNRNP48Q6IEG0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNRNP48Q6IEG0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNRNP48Q6IEG0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNRNP48Q6IEG0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNRNP48Q6IEG0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNRNP48Q6IEG0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNRNP48Q6IEG0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SNRNP48Q6IEG0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SNRNP48Q6IEG0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNRNP48Q6IEG0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNRNP48Q6IEG0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNRNP48Q6IEG0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNRNP48Q6IEG0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNRNP48Q6IEG0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNRNP48Q6IEG0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SNRNP48Q6IEG0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SNRNP48Q6IEG0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SNRNP48Q6IEG0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNRNP48Q6IEG0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNRNP48Q6IEG0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNRNP48Q6IEG0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNRNP48Q6IEG0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNRNP48Q6IEG0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNRNP48Q6IEG0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNRNP48Q6IEG0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SNRNP48Q6IEG0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNRNP48Q6IEG0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNRNP48Q6IEG0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNRNP48Q6IEG0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNRNP48Q6IEG0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNRNP48Q6IEG0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SNRNP48Q6IEG0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNRNP48Q6IEG0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNRNP48Q6IEG0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNRNP48Q6IEG0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNRNP48Q6IEG0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNRNP48Q6IEG0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SNRNP48Q6IEG0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNRNP48Q6IEG0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNRNP48Q6IEG0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNRNP48Q6IEG0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SNRNP48Q6IEG0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SNRNP48Q6IEG0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SNRNP48Q6IEG0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SNRNP48Q6IEG0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SNRNP48Q6IEG0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SNRNP48Q6IEG0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SNRNP48Q6IEG0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SNRNP48Q6IEG0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SNRNP48Q6IEG0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNRNP48Q6IEG0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNRNP48Q6IEG0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNRNP48Q6IEG0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNRNP48Q6IEG0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNRNP48Q6IEG0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNRNP48Q6IEG0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNRNP48Q6IEG0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNRNP48Q6IEG0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNRNP48Q6IEG0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNRNP48Q6IEG0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNRNP48Q6IEG0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNRNP48Q6IEG0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNRNP48Q6IEG0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNRNP48Q6IEG0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNRNP48Q6IEG0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SNRNP48Q6IEG0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNRNP48Q6IEG0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNRNP48Q6IEG0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SNRNP48Q6IEG0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SNRNP48Q6IEG0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SNRNP48Q6IEG0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SNRNP48Q6IEG0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SNRNP48Q6IEG0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SNRNP48Q6IEG0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SNRNP48Q6IEG0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SNRNP48Q6IEG0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms