Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG99

LYSMD4, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD4Q5XG99 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LYSMD4Q5XG99 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LYSMD4Q5XG99 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LYSMD4Q5XG99 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LYSMD4Q5XG99 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LYSMD4Q5XG99 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LYSMD4Q5XG99 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LYSMD4Q5XG99 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LYSMD4Q5XG99 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LYSMD4Q5XG99 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LYSMD4Q5XG99 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LYSMD4Q5XG99 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LYSMD4Q5XG99 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LYSMD4Q5XG99 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LYSMD4Q5XG99 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LYSMD4Q5XG99 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LYSMD4Q5XG99 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LYSMD4Q5XG99 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LYSMD4Q5XG99 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LYSMD4Q5XG99 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LYSMD4Q5XG99 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LYSMD4Q5XG99 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LYSMD4Q5XG99 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LYSMD4Q5XG99 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LYSMD4Q5XG99 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LYSMD4Q5XG99 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LYSMD4Q5XG99 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LYSMD4Q5XG99 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LYSMD4Q5XG99 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LYSMD4Q5XG99 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LYSMD4Q5XG99 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LYSMD4Q5XG99 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LYSMD4Q5XG99 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LYSMD4Q5XG99 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LYSMD4Q5XG99 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LYSMD4Q5XG99 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LYSMD4Q5XG99 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LYSMD4Q5XG99 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LYSMD4Q5XG99 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LYSMD4Q5XG99 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LYSMD4Q5XG99 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LYSMD4Q5XG99 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LYSMD4Q5XG99 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LYSMD4Q5XG99 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LYSMD4Q5XG99 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LYSMD4Q5XG99 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LYSMD4Q5XG99 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LYSMD4Q5XG99 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LYSMD4Q5XG99 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LYSMD4Q5XG99 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LYSMD4Q5XG99 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LYSMD4Q5XG99 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LYSMD4Q5XG99 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LYSMD4Q5XG99 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LYSMD4Q5XG99 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LYSMD4Q5XG99 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LYSMD4Q5XG99 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LYSMD4Q5XG99 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LYSMD4Q5XG99 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LYSMD4Q5XG99 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LYSMD4Q5XG99 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LYSMD4Q5XG99 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LYSMD4Q5XG99 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LYSMD4Q5XG99 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LYSMD4Q5XG99 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LYSMD4Q5XG99 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LYSMD4Q5XG99 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LYSMD4Q5XG99 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LYSMD4Q5XG99 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LYSMD4Q5XG99 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LYSMD4Q5XG99 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LYSMD4Q5XG99 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LYSMD4Q5XG99 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LYSMD4Q5XG99 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LYSMD4Q5XG99 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LYSMD4Q5XG99 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LYSMD4Q5XG99 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LYSMD4Q5XG99 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LYSMD4Q5XG99 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LYSMD4Q5XG99 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LYSMD4Q5XG99 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LYSMD4Q5XG99 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LYSMD4Q5XG99 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LYSMD4Q5XG99 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LYSMD4Q5XG99 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LYSMD4Q5XG99 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LYSMD4Q5XG99 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LYSMD4Q5XG99 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LYSMD4Q5XG99 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LYSMD4Q5XG99 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LYSMD4Q5XG99 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LYSMD4Q5XG99 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LYSMD4Q5XG99 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LYSMD4Q5XG99 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LYSMD4Q5XG99 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LYSMD4Q5XG99 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LYSMD4Q5XG99 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LYSMD4Q5XG99 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LYSMD4Q5XG99 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LYSMD4Q5XG99 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms