Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ODF4Q2M2E3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ODF4Q2M2E3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ODF4Q2M2E3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ODF4Q2M2E3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ODF4Q2M2E3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ODF4Q2M2E3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ODF4Q2M2E3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ODF4Q2M2E3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ODF4Q2M2E3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ODF4Q2M2E3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ODF4Q2M2E3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ODF4Q2M2E3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ODF4Q2M2E3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ODF4Q2M2E3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ODF4Q2M2E3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ODF4Q2M2E3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ODF4Q2M2E3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ODF4Q2M2E3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ODF4Q2M2E3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ODF4Q2M2E3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ODF4Q2M2E3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ODF4Q2M2E3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ODF4Q2M2E3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ODF4Q2M2E3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ODF4Q2M2E3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ODF4Q2M2E3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ODF4Q2M2E3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ODF4Q2M2E3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ODF4Q2M2E3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ODF4Q2M2E3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ODF4Q2M2E3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ODF4Q2M2E3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ODF4Q2M2E3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ODF4Q2M2E3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ODF4Q2M2E3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ODF4Q2M2E3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ODF4Q2M2E3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ODF4Q2M2E3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ODF4Q2M2E3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ODF4Q2M2E3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ODF4Q2M2E3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ODF4Q2M2E3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ODF4Q2M2E3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ODF4Q2M2E3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ODF4Q2M2E3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ODF4Q2M2E3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ODF4Q2M2E3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ODF4Q2M2E3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ODF4Q2M2E3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ODF4Q2M2E3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ODF4Q2M2E3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ODF4Q2M2E3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ODF4Q2M2E3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ODF4Q2M2E3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ODF4Q2M2E3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ODF4Q2M2E3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ODF4Q2M2E3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ODF4Q2M2E3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ODF4Q2M2E3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ODF4Q2M2E3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ODF4Q2M2E3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ODF4Q2M2E3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ODF4Q2M2E3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ODF4Q2M2E3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ODF4Q2M2E3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ODF4Q2M2E3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ODF4Q2M2E3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ODF4Q2M2E3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ODF4Q2M2E3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ODF4Q2M2E3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ODF4Q2M2E3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ODF4Q2M2E3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ODF4Q2M2E3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ODF4Q2M2E3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ODF4Q2M2E3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ODF4Q2M2E3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ODF4Q2M2E3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ODF4Q2M2E3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ODF4Q2M2E3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ODF4Q2M2E3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ODF4Q2M2E3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ODF4Q2M2E3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ODF4Q2M2E3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ODF4Q2M2E3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ODF4Q2M2E3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ODF4Q2M2E3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ODF4Q2M2E3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ODF4Q2M2E3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ODF4Q2M2E3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ODF4Q2M2E3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ODF4Q2M2E3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ODF4Q2M2E3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ODF4Q2M2E3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ODF4Q2M2E3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ODF4Q2M2E3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ODF4Q2M2E3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ODF4Q2M2E3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ODF4Q2M2E3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ODF4Q2M2E3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms