Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 826 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIF1AQ16665 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIF1AQ16665 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIF1AQ16665 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIF1AQ16665 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIF1AQ16665 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIF1AQ16665 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIF1AQ16665 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIF1AQ16665 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HIF1AQ16665 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIF1AQ16665 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HIF1AQ16665 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HIF1AQ16665 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HIF1AQ16665 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HIF1AQ16665 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HIF1AQ16665 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HIF1AQ16665 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HIF1AQ16665 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HIF1AQ16665 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIF1AQ16665 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIF1AQ16665 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIF1AQ16665 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIF1AQ16665 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIF1AQ16665 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HIF1AQ16665 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIF1AQ16665 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIF1AQ16665 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIF1AQ16665 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIF1AQ16665 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIF1AQ16665 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIF1AQ16665 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIF1AQ16665 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIF1AQ16665 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIF1AQ16665 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIF1AQ16665 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIF1AQ16665 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIF1AQ16665 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIF1AQ16665 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HIF1AQ16665 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIF1AQ16665 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIF1AQ16665 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIF1AQ16665 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIF1AQ16665 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIF1AQ16665 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIF1AQ16665 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HIF1AQ16665 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIF1AQ16665 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIF1AQ16665 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIF1AQ16665 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIF1AQ16665 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIF1AQ16665 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIF1AQ16665 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HIF1AQ16665 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIF1AQ16665 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIF1AQ16665 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIF1AQ16665 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIF1AQ16665 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIF1AQ16665 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIF1AQ16665 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIF1AQ16665 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIF1AQ16665 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIF1AQ16665 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIF1AQ16665 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIF1AQ16665 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIF1AQ16665 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIF1AQ16665 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIF1AQ16665 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HIF1AQ16665 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HIF1AQ16665 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIF1AQ16665 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIF1AQ16665 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIF1AQ16665 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIF1AQ16665 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HIF1AQ16665 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HIF1AQ16665 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HIF1AQ16665 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIF1AQ16665 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIF1AQ16665 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIF1AQ16665 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIF1AQ16665 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIF1AQ16665 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIF1AQ16665 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIF1AQ16665 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIF1AQ16665 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIF1AQ16665 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIF1AQ16665 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HIF1AQ16665 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIF1AQ16665 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIF1AQ16665 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIF1AQ16665 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIF1AQ16665 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HIF1AQ16665 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIF1AQ16665 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIF1AQ16665 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIF1AQ16665 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIF1AQ16665 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIF1AQ16665 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIF1AQ16665 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIF1AQ16665 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HIF1AQ16665 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms