Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FXNQ16595 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FXNQ16595 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FXNQ16595 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FXNQ16595 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FXNQ16595 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FXNQ16595 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FXNQ16595 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FXNQ16595 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FXNQ16595 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FXNQ16595 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FXNQ16595 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FXNQ16595 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FXNQ16595 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FXNQ16595 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FXNQ16595 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FXNQ16595 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FXNQ16595 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FXNQ16595 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FXNQ16595 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FXNQ16595 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FXNQ16595 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FXNQ16595 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FXNQ16595 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FXNQ16595 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FXNQ16595 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FXNQ16595 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FXNQ16595 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FXNQ16595 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FXNQ16595 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FXNQ16595 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FXNQ16595 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FXNQ16595 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FXNQ16595 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FXNQ16595 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FXNQ16595 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FXNQ16595 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FXNQ16595 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FXNQ16595 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FXNQ16595 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FXNQ16595 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FXNQ16595 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FXNQ16595 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FXNQ16595 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FXNQ16595 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FXNQ16595 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FXNQ16595 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FXNQ16595 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FXNQ16595 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FXNQ16595 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FXNQ16595 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FXNQ16595 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FXNQ16595 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FXNQ16595 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FXNQ16595 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FXNQ16595 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FXNQ16595 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FXNQ16595 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FXNQ16595 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FXNQ16595 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FXNQ16595 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FXNQ16595 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FXNQ16595 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FXNQ16595 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FXNQ16595 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FXNQ16595 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FXNQ16595 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FXNQ16595 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FXNQ16595 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FXNQ16595 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FXNQ16595 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FXNQ16595 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FXNQ16595 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FXNQ16595 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FXNQ16595 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FXNQ16595 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FXNQ16595 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FXNQ16595 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FXNQ16595 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FXNQ16595 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FXNQ16595 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FXNQ16595 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FXNQ16595 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FXNQ16595 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FXNQ16595 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FXNQ16595 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FXNQ16595 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FXNQ16595 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FXNQ16595 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FXNQ16595 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FXNQ16595 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FXNQ16595 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FXNQ16595 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FXNQ16595 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FXNQ16595 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FXNQ16595 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FXNQ16595 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FXNQ16595 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FXNQ16595 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FXNQ16595 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
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