Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NFX1Q12986 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NFX1Q12986 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NFX1Q12986 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NFX1Q12986 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFX1Q12986 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFX1Q12986 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFX1Q12986 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFX1Q12986 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFX1Q12986 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFX1Q12986 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFX1Q12986 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NFX1Q12986 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NFX1Q12986 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NFX1Q12986 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NFX1Q12986 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NFX1Q12986 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NFX1Q12986 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NFX1Q12986 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NFX1Q12986 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NFX1Q12986 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NFX1Q12986 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NFX1Q12986 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NFX1Q12986 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFX1Q12986 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFX1Q12986 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFX1Q12986 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFX1Q12986 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFX1Q12986 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFX1Q12986 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFX1Q12986 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFX1Q12986 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFX1Q12986 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NFX1Q12986 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NFX1Q12986 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NFX1Q12986 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NFX1Q12986 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFX1Q12986 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFX1Q12986 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFX1Q12986 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFX1Q12986 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFX1Q12986 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFX1Q12986 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFX1Q12986 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFX1Q12986 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFX1Q12986 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NFX1Q12986 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFX1Q12986 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFX1Q12986 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFX1Q12986 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFX1Q12986 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFX1Q12986 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFX1Q12986 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFX1Q12986 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFX1Q12986 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFX1Q12986 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFX1Q12986 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFX1Q12986 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFX1Q12986 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFX1Q12986 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NFX1Q12986 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFX1Q12986 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFX1Q12986 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NFX1Q12986 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NFX1Q12986 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NFX1Q12986 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NFX1Q12986 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NFX1Q12986 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NFX1Q12986 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NFX1Q12986 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NFX1Q12986 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
NFX1Q12986 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
NFX1Q12986 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NFX1Q12986 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NFX1Q12986 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NFX1Q12986 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NFX1Q12986 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NFX1Q12986 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NFX1Q12986 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NFX1Q12986 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NFX1Q12986 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NFX1Q12986 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NFX1Q12986 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NFX1Q12986 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NFX1Q12986 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NFX1Q12986 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NFX1Q12986 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NFX1Q12986 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NFX1Q12986 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NFX1Q12986 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NFX1Q12986 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NFX1Q12986 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NFX1Q12986 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NFX1Q12986 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NFX1Q12986 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NFX1Q12986 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NFX1Q12986 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NFX1Q12986 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NFX1Q12986 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NFX1Q12986 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
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