Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3C1Q12789 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3C1Q12789 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3C1Q12789 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3C1Q12789 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3C1Q12789 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3C1Q12789 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C1Q12789 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3C1Q12789 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GTF3C1Q12789 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GTF3C1Q12789 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GTF3C1Q12789 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C1Q12789 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C1Q12789 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C1Q12789 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C1Q12789 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3C1Q12789 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF3C1Q12789 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF3C1Q12789 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF3C1Q12789 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF3C1Q12789 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF3C1Q12789 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF3C1Q12789 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C1Q12789 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C1Q12789 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C1Q12789 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C1Q12789 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C1Q12789 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF3C1Q12789 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF3C1Q12789 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF3C1Q12789 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF3C1Q12789 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF3C1Q12789 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF3C1Q12789 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF3C1Q12789 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF3C1Q12789 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF3C1Q12789 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF3C1Q12789 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF3C1Q12789 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF3C1Q12789 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF3C1Q12789 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF3C1Q12789 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF3C1Q12789 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF3C1Q12789 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF3C1Q12789 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF3C1Q12789 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GTF3C1Q12789 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GTF3C1Q12789 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
GTF3C1Q12789 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GTF3C1Q12789 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GTF3C1Q12789 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF3C1Q12789 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF3C1Q12789 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF3C1Q12789 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF3C1Q12789 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF3C1Q12789 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF3C1Q12789 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF3C1Q12789 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF3C1Q12789 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF3C1Q12789 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF3C1Q12789 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF3C1Q12789 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF3C1Q12789 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF3C1Q12789 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF3C1Q12789 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF3C1Q12789 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF3C1Q12789 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3C1Q12789 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3C1Q12789 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3C1Q12789 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3C1Q12789 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3C1Q12789 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3C1Q12789 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3C1Q12789 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3C1Q12789 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF3C1Q12789 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF3C1Q12789 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF3C1Q12789 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF3C1Q12789 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF3C1Q12789 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF3C1Q12789 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF3C1Q12789 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF3C1Q12789 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF3C1Q12789 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF3C1Q12789 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF3C1Q12789 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF3C1Q12789 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GTF3C1Q12789 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF3C1Q12789 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF3C1Q12789 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF3C1Q12789 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF3C1Q12789 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF3C1Q12789 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF3C1Q12789 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF3C1Q12789 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF3C1Q12789 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF3C1Q12789 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF3C1Q12789 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF3C1Q12789 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF3C1Q12789 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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