Protein–RNA interactions for Protein: Q12441

TY1A-DR3, Transposon Ty1-DR3 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-DR3Q12441 VRP1YLR337C 2454 nt7.34□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 PMT7YDR307W 1989 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 LDB17YDL146W 1476 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 MMM1YLL006W 1281 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 RAS2YNL098C 969 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 GPM3YOL056W 912 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 ODC2YOR222W 924 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 SUV3YPL029W 2214 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 FRT1YOR324C 1809 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 ITR1YDR497C 1755 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 SAM3YPL274W 1764 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 YPK3YBR028C 1578 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 YMR265CYMR265C 1386 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 PAP1YKR002W 1707 nt7.32□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 MEK1YOR351C 1494 nt7.32□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 AFG2YLR397C 2343 nt7.32□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 GIC2YDR309C 1152 nt7.32□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 YFR018CYFR018C 1092 nt7.32□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 PRI1YIR008C 1230 nt7.32□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 PSR2YLR019W 1194 nt7.32□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 YNL140CYNL140C 570 nt7.32□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 CHL4YDR254W 1377 nt7.32□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 DIA4YHR011W 1341 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 BUD9YGR041W 1644 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 CBS2YDR197W 1170 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 RTT103YDR289C 1230 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 ERV14YGL054C 417 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 YUR1YJL139C 1287 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 RPS14BYJL191W 417 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 RRT7YLL030C 342 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 REH1YLR387C 1299 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 YMR245WYMR245W 621 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 PRC1YMR297W 1599 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 YOR024WYOR024W 324 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 PBI1YPL272C 1554 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 EAF3YPR023C 1206 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 FRA1YLL029W 2250 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 UBP13YBL067C 2244 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 TOP3YLR234W 1971 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 HTB1YDR224C 396 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 HUA1YGR268C 597 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 ARD1YHR013C 717 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 MND2YIR025W 1107 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 LAC1YKL008C 1257 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 RRT1YBL048W 312 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 LPL1YOR059C 1353 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 SLM3YDL033C 1254 nt7.29□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 MNN10YDR245W 1182 nt7.29□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 TRS23YDR246W 660 nt7.29□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 YGL214WYGL214W 486 nt7.29□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 RRF1YHR038W 693 nt7.29□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 GPM1YKL152C 744 nt7.29□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 ECM1YAL059W 639 nt7.29□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 USB1YLR132C 873 nt7.29□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 GCD11YER025W 1584 nt7.29□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 GTT1YIR038C 705 nt7.28□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 CMS1YLR003C 876 nt7.28□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 YPR142CYPR142C 564 nt7.28□□□□□ -1.24
TY1A-DR3Q12441 GUS1YGL245W 2127 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1A-DR3Q12441 RPL4BYDR012W 1089 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1A-DR3Q12441 UPS3YDR185C 540 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1A-DR3Q12441 IST3YIR005W 447 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1A-DR3Q12441 IRC9YJL142C 393 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1A-DR3Q12441 NUC1YJL208C 990 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1A-DR3Q12441 YBL095WYBL095W 813 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1A-DR3Q12441 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1A-DR3Q12441 RPL4AYBR031W 1089 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1A-DR3Q12441 LEA1YPL213W 717 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1A-DR3Q12441 FCY21YER060W 1587 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1A-DR3Q12441 THI3YDL080C 1830 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1A-DR3Q12441 ABP1YCR088W 1779 nt7.26□□□□□ -1.25
TY1A-DR3Q12441 YDR514CYDR514C 1452 nt7.26□□□□□ -1.25
TY1A-DR3Q12441 RPC25YKL144C 639 nt7.26□□□□□ -1.25
TY1A-DR3Q12441 NTR2YKR022C 969 nt7.26□□□□□ -1.25
TY1A-DR3Q12441 PSR1YLL010C 1284 nt7.26□□□□□ -1.25
TY1A-DR3Q12441 SEC72YLR292C 582 nt7.26□□□□□ -1.25
TY1A-DR3Q12441 YOL106WYOL106W 354 nt7.26□□□□□ -1.25
TY1A-DR3Q12441 SFG1YOR315W 1041 nt7.26□□□□□ -1.25
TY1A-DR3Q12441 CKS1YBR135W 453 nt7.26□□□□□ -1.25
TY1A-DR3Q12441 LDH1YBR204C 1128 nt7.26□□□□□ -1.25
TY1A-DR3Q12441 ECM27YJR106W 2178 nt7.25□□□□□ -1.25
TY1A-DR3Q12441 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt7.25□□□□□ -1.25
TY1A-DR3Q12441 IRC25YLR021W 540 nt7.25□□□□□ -1.25
TY1A-DR3Q12441 CPR6YLR216C 1116 nt7.25□□□□□ -1.25
TY1A-DR3Q12441 HAP5YOR358W 729 nt7.25□□□□□ -1.25
TY1A-DR3Q12441 CNS1YBR155W 1158 nt7.25□□□□□ -1.25
TY1A-DR3Q12441 RIT1YMR283C 1542 nt7.25□□□□□ -1.25
TY1A-DR3Q12441 PET112YBL080C 1626 nt7.24□□□□□ -1.25
TY1A-DR3Q12441 POP6YGR030C 477 nt7.24□□□□□ -1.25
TY1A-DR3Q12441 TFA2YKR062W 987 nt7.24□□□□□ -1.25
TY1A-DR3Q12441 YLR456WYLR456W 615 nt7.24□□□□□ -1.25
TY1A-DR3Q12441 GRX5YPL059W 453 nt7.24□□□□□ -1.25
TY1A-DR3Q12441 YPR147CYPR147C 915 nt7.24□□□□□ -1.25
TY1A-DR3Q12441 MAK11YKL021C 1407 nt7.24□□□□□ -1.25
TY1A-DR3Q12441 ECM18YDR125C 1362 nt7.23□□□□□ -1.25
TY1A-DR3Q12441 YGR016WYGR016W 573 nt7.23□□□□□ -1.25
TY1A-DR3Q12441 YLR279WYLR279W 390 nt7.23□□□□□ -1.25
TY1A-DR3Q12441 CRC1YOR100C 984 nt7.23□□□□□ -1.25
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