Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM27E3Q08E93 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM27E3Q08E93 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM27E3Q08E93 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM27E3Q08E93 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM27E3Q08E93 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM27E3Q08E93 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM27E3Q08E93 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM27E3Q08E93 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM27E3Q08E93 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM27E3Q08E93 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM27E3Q08E93 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM27E3Q08E93 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM27E3Q08E93 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM27E3Q08E93 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM27E3Q08E93 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM27E3Q08E93 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM27E3Q08E93 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM27E3Q08E93 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM27E3Q08E93 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM27E3Q08E93 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM27E3Q08E93 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM27E3Q08E93 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM27E3Q08E93 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM27E3Q08E93 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM27E3Q08E93 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM27E3Q08E93 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM27E3Q08E93 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM27E3Q08E93 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM27E3Q08E93 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM27E3Q08E93 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM27E3Q08E93 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM27E3Q08E93 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM27E3Q08E93 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM27E3Q08E93 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM27E3Q08E93 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM27E3Q08E93 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM27E3Q08E93 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM27E3Q08E93 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM27E3Q08E93 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM27E3Q08E93 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM27E3Q08E93 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM27E3Q08E93 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM27E3Q08E93 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM27E3Q08E93 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM27E3Q08E93 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM27E3Q08E93 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM27E3Q08E93 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM27E3Q08E93 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM27E3Q08E93 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM27E3Q08E93 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM27E3Q08E93 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM27E3Q08E93 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM27E3Q08E93 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM27E3Q08E93 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FAM27E3Q08E93 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FAM27E3Q08E93 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FAM27E3Q08E93 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM27E3Q08E93 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM27E3Q08E93 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM27E3Q08E93 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FAM27E3Q08E93 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM27E3Q08E93 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM27E3Q08E93 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FAM27E3Q08E93 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM27E3Q08E93 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM27E3Q08E93 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM27E3Q08E93 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM27E3Q08E93 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM27E3Q08E93 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM27E3Q08E93 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM27E3Q08E93 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM27E3Q08E93 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM27E3Q08E93 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM27E3Q08E93 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM27E3Q08E93 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FAM27E3Q08E93 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM27E3Q08E93 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM27E3Q08E93 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM27E3Q08E93 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM27E3Q08E93 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM27E3Q08E93 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM27E3Q08E93 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM27E3Q08E93 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM27E3Q08E93 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM27E3Q08E93 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM27E3Q08E93 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM27E3Q08E93 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM27E3Q08E93 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM27E3Q08E93 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM27E3Q08E93 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM27E3Q08E93 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM27E3Q08E93 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM27E3Q08E93 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM27E3Q08E93 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM27E3Q08E93 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM27E3Q08E93 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM27E3Q08E93 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM27E3Q08E93 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM27E3Q08E93 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms