Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP4F3Q08477 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP4F3Q08477 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP4F3Q08477 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP4F3Q08477 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP4F3Q08477 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP4F3Q08477 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP4F3Q08477 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP4F3Q08477 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP4F3Q08477 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP4F3Q08477 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP4F3Q08477 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP4F3Q08477 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP4F3Q08477 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP4F3Q08477 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP4F3Q08477 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP4F3Q08477 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP4F3Q08477 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP4F3Q08477 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP4F3Q08477 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP4F3Q08477 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP4F3Q08477 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP4F3Q08477 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP4F3Q08477 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP4F3Q08477 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP4F3Q08477 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP4F3Q08477 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP4F3Q08477 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP4F3Q08477 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP4F3Q08477 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP4F3Q08477 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP4F3Q08477 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP4F3Q08477 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP4F3Q08477 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP4F3Q08477 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP4F3Q08477 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP4F3Q08477 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP4F3Q08477 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP4F3Q08477 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP4F3Q08477 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP4F3Q08477 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP4F3Q08477 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP4F3Q08477 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP4F3Q08477 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP4F3Q08477 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP4F3Q08477 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP4F3Q08477 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP4F3Q08477 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP4F3Q08477 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP4F3Q08477 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP4F3Q08477 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP4F3Q08477 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP4F3Q08477 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP4F3Q08477 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP4F3Q08477 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP4F3Q08477 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP4F3Q08477 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP4F3Q08477 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP4F3Q08477 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP4F3Q08477 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP4F3Q08477 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP4F3Q08477 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP4F3Q08477 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP4F3Q08477 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP4F3Q08477 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP4F3Q08477 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP4F3Q08477 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP4F3Q08477 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP4F3Q08477 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP4F3Q08477 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP4F3Q08477 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP4F3Q08477 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP4F3Q08477 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP4F3Q08477 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP4F3Q08477 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP4F3Q08477 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP4F3Q08477 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CYP4F3Q08477 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CYP4F3Q08477 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYP4F3Q08477 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYP4F3Q08477 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CYP4F3Q08477 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CYP4F3Q08477 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CYP4F3Q08477 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CYP4F3Q08477 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CYP4F3Q08477 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYP4F3Q08477 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CYP4F3Q08477 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYP4F3Q08477 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYP4F3Q08477 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYP4F3Q08477 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYP4F3Q08477 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CYP4F3Q08477 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYP4F3Q08477 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYP4F3Q08477 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYP4F3Q08477 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYP4F3Q08477 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYP4F3Q08477 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYP4F3Q08477 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYP4F3Q08477 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms