Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HERVK_113P62684 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HERVK_113P62684 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
HERVK_113P62684 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HERVK_113P62684 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HERVK_113P62684 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HERVK_113P62684 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
HERVK_113P62684 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HERVK_113P62684 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HERVK_113P62684 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HERVK_113P62684 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HERVK_113P62684 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HERVK_113P62684 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HERVK_113P62684 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HERVK_113P62684 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HERVK_113P62684 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HERVK_113P62684 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HERVK_113P62684 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HERVK_113P62684 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HERVK_113P62684 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HERVK_113P62684 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HERVK_113P62684 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HERVK_113P62684 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HERVK_113P62684 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HERVK_113P62684 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HERVK_113P62684 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HERVK_113P62684 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HERVK_113P62684 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HERVK_113P62684 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HERVK_113P62684 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HERVK_113P62684 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HERVK_113P62684 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HERVK_113P62684 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HERVK_113P62684 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HERVK_113P62684 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HERVK_113P62684 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HERVK_113P62684 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HERVK_113P62684 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HERVK_113P62684 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HERVK_113P62684 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HERVK_113P62684 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HERVK_113P62684 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HERVK_113P62684 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HERVK_113P62684 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HERVK_113P62684 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HERVK_113P62684 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HERVK_113P62684 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HERVK_113P62684 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HERVK_113P62684 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HERVK_113P62684 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HERVK_113P62684 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HERVK_113P62684 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
HERVK_113P62684 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HERVK_113P62684 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HERVK_113P62684 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
HERVK_113P62684 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
HERVK_113P62684 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HERVK_113P62684 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HERVK_113P62684 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HERVK_113P62684 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
HERVK_113P62684 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HERVK_113P62684 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HERVK_113P62684 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HERVK_113P62684 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HERVK_113P62684 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
HERVK_113P62684 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HERVK_113P62684 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
HERVK_113P62684 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HERVK_113P62684 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HERVK_113P62684 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HERVK_113P62684 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HERVK_113P62684 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HERVK_113P62684 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HERVK_113P62684 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HERVK_113P62684 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HERVK_113P62684 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HERVK_113P62684 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
HERVK_113P62684 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HERVK_113P62684 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HERVK_113P62684 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HERVK_113P62684 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HERVK_113P62684 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HERVK_113P62684 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HERVK_113P62684 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HERVK_113P62684 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HERVK_113P62684 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HERVK_113P62684 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HERVK_113P62684 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HERVK_113P62684 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HERVK_113P62684 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HERVK_113P62684 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HERVK_113P62684 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HERVK_113P62684 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HERVK_113P62684 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HERVK_113P62684 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HERVK_113P62684 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HERVK_113P62684 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
HERVK_113P62684 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
HERVK_113P62684 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HERVK_113P62684 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms