Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RHBDL3P58872 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
RHBDL3P58872 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RHBDL3P58872 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RHBDL3P58872 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RHBDL3P58872 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RHBDL3P58872 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RHBDL3P58872 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RHBDL3P58872 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RHBDL3P58872 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
RHBDL3P58872 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RHBDL3P58872 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RHBDL3P58872 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RHBDL3P58872 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RHBDL3P58872 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RHBDL3P58872 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RHBDL3P58872 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RHBDL3P58872 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RHBDL3P58872 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RHBDL3P58872 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RHBDL3P58872 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RHBDL3P58872 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RHBDL3P58872 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RHBDL3P58872 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RHBDL3P58872 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
RHBDL3P58872 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
RHBDL3P58872 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RHBDL3P58872 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RHBDL3P58872 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RHBDL3P58872 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RHBDL3P58872 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RHBDL3P58872 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RHBDL3P58872 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RHBDL3P58872 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RHBDL3P58872 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RHBDL3P58872 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RHBDL3P58872 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RHBDL3P58872 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
RHBDL3P58872 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RHBDL3P58872 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RHBDL3P58872 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RHBDL3P58872 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RHBDL3P58872 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RHBDL3P58872 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
RHBDL3P58872 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RHBDL3P58872 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RHBDL3P58872 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RHBDL3P58872 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RHBDL3P58872 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RHBDL3P58872 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RHBDL3P58872 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RHBDL3P58872 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RHBDL3P58872 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
RHBDL3P58872 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RHBDL3P58872 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RHBDL3P58872 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RHBDL3P58872 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RHBDL3P58872 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RHBDL3P58872 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RHBDL3P58872 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RHBDL3P58872 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RHBDL3P58872 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RHBDL3P58872 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RHBDL3P58872 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
RHBDL3P58872 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
RHBDL3P58872 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RHBDL3P58872 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RHBDL3P58872 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RHBDL3P58872 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RHBDL3P58872 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RHBDL3P58872 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RHBDL3P58872 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RHBDL3P58872 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RHBDL3P58872 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RHBDL3P58872 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RHBDL3P58872 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RHBDL3P58872 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RHBDL3P58872 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
RHBDL3P58872 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RHBDL3P58872 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RHBDL3P58872 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RHBDL3P58872 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RHBDL3P58872 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RHBDL3P58872 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RHBDL3P58872 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RHBDL3P58872 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
RHBDL3P58872 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RHBDL3P58872 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RHBDL3P58872 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RHBDL3P58872 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RHBDL3P58872 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RHBDL3P58872 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
RHBDL3P58872 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RHBDL3P58872 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RHBDL3P58872 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
RHBDL3P58872 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RHBDL3P58872 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RHBDL3P58872 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RHBDL3P58872 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RHBDL3P58872 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms