Protein–RNA interactions for Protein: P47224

RABIF, Guanine nucleotide exchange factor MSS4, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABIFP47224 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RABIFP47224 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RABIFP47224 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RABIFP47224 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RABIFP47224 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RABIFP47224 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RABIFP47224 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RABIFP47224 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RABIFP47224 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RABIFP47224 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RABIFP47224 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RABIFP47224 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RABIFP47224 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RABIFP47224 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RABIFP47224 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RABIFP47224 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RABIFP47224 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RABIFP47224 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RABIFP47224 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RABIFP47224 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RABIFP47224 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RABIFP47224 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RABIFP47224 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RABIFP47224 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RABIFP47224 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RABIFP47224 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RABIFP47224 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RABIFP47224 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RABIFP47224 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RABIFP47224 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RABIFP47224 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RABIFP47224 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RABIFP47224 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RABIFP47224 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RABIFP47224 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RABIFP47224 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RABIFP47224 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RABIFP47224 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RABIFP47224 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RABIFP47224 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RABIFP47224 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RABIFP47224 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RABIFP47224 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RABIFP47224 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RABIFP47224 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RABIFP47224 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RABIFP47224 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RABIFP47224 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RABIFP47224 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RABIFP47224 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RABIFP47224 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RABIFP47224 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RABIFP47224 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RABIFP47224 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RABIFP47224 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RABIFP47224 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RABIFP47224 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RABIFP47224 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RABIFP47224 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RABIFP47224 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RABIFP47224 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RABIFP47224 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RABIFP47224 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RABIFP47224 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RABIFP47224 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RABIFP47224 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RABIFP47224 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RABIFP47224 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RABIFP47224 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RABIFP47224 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RABIFP47224 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RABIFP47224 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RABIFP47224 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RABIFP47224 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RABIFP47224 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RABIFP47224 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RABIFP47224 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RABIFP47224 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RABIFP47224 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RABIFP47224 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RABIFP47224 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RABIFP47224 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RABIFP47224 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RABIFP47224 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RABIFP47224 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RABIFP47224 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RABIFP47224 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RABIFP47224 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RABIFP47224 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RABIFP47224 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RABIFP47224 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RABIFP47224 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RABIFP47224 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RABIFP47224 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RABIFP47224 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RABIFP47224 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RABIFP47224 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RABIFP47224 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RABIFP47224 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RABIFP47224 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms