Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIA2P42262 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIA2P42262 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIA2P42262 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIA2P42262 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIA2P42262 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIA2P42262 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIA2P42262 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIA2P42262 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIA2P42262 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIA2P42262 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIA2P42262 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIA2P42262 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIA2P42262 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIA2P42262 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIA2P42262 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIA2P42262 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIA2P42262 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIA2P42262 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIA2P42262 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIA2P42262 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIA2P42262 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIA2P42262 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIA2P42262 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIA2P42262 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIA2P42262 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIA2P42262 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIA2P42262 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GRIA2P42262 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
GRIA2P42262 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIA2P42262 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIA2P42262 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIA2P42262 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIA2P42262 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIA2P42262 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIA2P42262 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIA2P42262 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIA2P42262 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIA2P42262 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIA2P42262 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIA2P42262 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIA2P42262 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIA2P42262 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIA2P42262 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIA2P42262 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIA2P42262 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIA2P42262 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIA2P42262 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIA2P42262 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIA2P42262 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIA2P42262 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIA2P42262 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIA2P42262 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIA2P42262 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIA2P42262 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIA2P42262 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIA2P42262 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIA2P42262 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIA2P42262 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIA2P42262 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIA2P42262 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIA2P42262 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIA2P42262 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIA2P42262 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIA2P42262 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIA2P42262 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIA2P42262 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIA2P42262 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIA2P42262 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIA2P42262 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIA2P42262 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIA2P42262 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIA2P42262 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIA2P42262 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GRIA2P42262 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRIA2P42262 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRIA2P42262 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GRIA2P42262 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIA2P42262 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIA2P42262 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIA2P42262 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIA2P42262 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIA2P42262 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIA2P42262 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIA2P42262 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIA2P42262 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIA2P42262 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIA2P42262 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIA2P42262 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIA2P42262 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIA2P42262 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIA2P42262 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIA2P42262 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIA2P42262 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIA2P42262 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIA2P42262 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIA2P42262 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIA2P42262 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIA2P42262 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIA2P42262 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms