Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 VPS61YDR136C 573 nt6.05□□□□□ -1.44
DDI1P40087 DMA1YHR115C 1251 nt6.05□□□□□ -1.44
DDI1P40087 SEC62YPL094C 825 nt6.05□□□□□ -1.44
DDI1P40087 LSG1YGL099W 1923 nt6.05□□□□□ -1.44
DDI1P40087 YEL020CYEL020C 1683 nt6.04□□□□□ -1.44
DDI1P40087 PRY3YJL078C 2646 nt6.04□□□□□ -1.44
DDI1P40087 SAC6YDR129C 1929 nt6.04□□□□□ -1.44
DDI1P40087 TRR2YHR106W 1029 nt6.04□□□□□ -1.44
DDI1P40087 YIL077CYIL077C 963 nt6.04□□□□□ -1.44
DDI1P40087 AIM24YJR080C 1185 nt6.04□□□□□ -1.44
DDI1P40087 OAC1YKL120W 975 nt6.04□□□□□ -1.44
DDI1P40087 PRE5YMR314W 705 nt6.04□□□□□ -1.44
DDI1P40087 COX10YPL172C 1389 nt6.04□□□□□ -1.44
DDI1P40087 ICP55YER078C 1536 nt6.04□□□□□ -1.44
DDI1P40087 HGH1YGR187C 1185 nt6.03□□□□□ -1.44
DDI1P40087 YJR146WYJR146W 354 nt6.03□□□□□ -1.44
DDI1P40087 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt6.03□□□□□ -1.44
DDI1P40087 SWD1YAR003W 1281 nt6.03□□□□□ -1.44
DDI1P40087 RKI1YOR095C 777 nt6.03□□□□□ -1.44
DDI1P40087 HAS1YMR290C 1518 nt6.03□□□□□ -1.44
DDI1P40087 GYP8YFL027C 1494 nt6.02□□□□□ -1.44
DDI1P40087 MRPL1YDR116C 858 nt6.02□□□□□ -1.45
DDI1P40087 EDC2YER035W 438 nt6.02□□□□□ -1.45
DDI1P40087 OGG1YML060W 1131 nt6.02□□□□□ -1.45
DDI1P40087 YPQ1YOL092W 927 nt6.02□□□□□ -1.45
DDI1P40087 COQ3YOL096C 939 nt6.02□□□□□ -1.45
DDI1P40087 YPL067CYPL067C 597 nt6.02□□□□□ -1.45
DDI1P40087 LDB19YOR322C 2457 nt6.02□□□□□ -1.45
DDI1P40087 AFG1YEL052W 1530 nt6.01□□□□□ -1.45
DDI1P40087 HEM2YGL040C 1029 nt6.01□□□□□ -1.45
DDI1P40087 YCL049CYCL049C 939 nt6.01□□□□□ -1.45
DDI1P40087 GFA1YKL104C 2154 nt6.01□□□□□ -1.45
DDI1P40087 EHD3YDR036C 1503 nt6□□□□□ -1.45
DDI1P40087 YLR312CYLR312C 1197 nt6□□□□□ -1.45
DDI1P40087 PRS4YBL068W 981 nt6□□□□□ -1.45
DDI1P40087 MTC5YDR128W 3447 nt5.99□□□□□ -1.45
DDI1P40087 MSC3YLR219W 2187 nt5.99□□□□□ -1.45
DDI1P40087 HSP150YJL159W 1242 nt5.99□□□□□ -1.45
DDI1P40087 BSC4YNL269W 396 nt5.99□□□□□ -1.45
DDI1P40087 DOT1YDR440W 1749 nt5.99□□□□□ -1.45
DDI1P40087 MFG1YDL233W 1377 nt5.98□□□□□ -1.45
DDI1P40087 PDA1YER178W 1263 nt5.98□□□□□ -1.45
DDI1P40087 ICT1YLR099C 1185 nt5.98□□□□□ -1.45
DDI1P40087 snR30snR30 606 nt5.98□□□□□ -1.45
DDI1P40087 PGM1YKL127W 1713 nt5.98□□□□□ -1.45
DDI1P40087 STB5YHR178W 2232 nt5.98□□□□□ -1.45
DDI1P40087 FET4YMR319C 1659 nt5.98□□□□□ -1.45
DDI1P40087 YDR514CYDR514C 1452 nt5.97□□□□□ -1.45
DDI1P40087 CIT3YPR001W 1461 nt5.97□□□□□ -1.45
DDI1P40087 HXT15YDL245C 1704 nt5.97□□□□□ -1.45
DDI1P40087 HXT16YJR158W 1704 nt5.97□□□□□ -1.45
DDI1P40087 ARA2YMR041C 1008 nt5.97□□□□□ -1.45
DDI1P40087 PTH2YBL057C 627 nt5.97□□□□□ -1.45
DDI1P40087 YNL092WYNL092W 1203 nt5.97□□□□□ -1.45
DDI1P40087 MKK1YOR231W 1527 nt5.96□□□□□ -1.46
DDI1P40087 SHO1YER118C 1104 nt5.96□□□□□ -1.46
DDI1P40087 YPL041CYPL041C 624 nt5.96□□□□□ -1.46
DDI1P40087 QCR8YJL166W 285 nt5.95□□□□□ -1.46
DDI1P40087 LAT1YNL071W 1449 nt5.95□□□□□ -1.46
DDI1P40087 YPL257WYPL257W 582 nt5.95□□□□□ -1.46
DDI1P40087 NTE1YML059C 5040 nt5.94□□□□□ -1.46
DDI1P40087 PIH1YHR034C 1035 nt5.94□□□□□ -1.46
DDI1P40087 YLR162WYLR162W 357 nt5.94□□□□□ -1.46
DDI1P40087 RPS28AYOR167C 204 nt5.94□□□□□ -1.46
DDI1P40087 PFK2YMR205C 2880 nt5.94□□□□□ -1.46
DDI1P40087 NUP49YGL172W 1419 nt5.93□□□□□ -1.46
DDI1P40087 YML079WYML079W 606 nt5.93□□□□□ -1.46
DDI1P40087 RUF23RUF23 254 nt5.93□□□□□ -1.46
DDI1P40087 YPR123CYPR123C 435 nt5.93□□□□□ -1.46
DDI1P40087 YHK8YHR048W 1545 nt5.93□□□□□ -1.46
DDI1P40087 YMR279CYMR279C 1623 nt5.92□□□□□ -1.46
DDI1P40087 STE13YOR219C 2796 nt5.92□□□□□ -1.46
DDI1P40087 COA1YIL157C 594 nt5.92□□□□□ -1.46
DDI1P40087 ATP4YPL078C 735 nt5.92□□□□□ -1.46
DDI1P40087 LDB16YCL005W 771 nt5.92□□□□□ -1.46
DDI1P40087 PYK2YOR347C 1521 nt5.91□□□□□ -1.46
DDI1P40087 FAL1YDR021W 1200 nt5.91□□□□□ -1.46
DDI1P40087 PSR2YLR019W 1194 nt5.91□□□□□ -1.46
DDI1P40087 IES2YNL215W 963 nt5.91□□□□□ -1.46
DDI1P40087 HIS7YBR248C 1659 nt5.91□□□□□ -1.46
DDI1P40087 UME1YPL139C 1383 nt5.91□□□□□ -1.46
DDI1P40087 MRS1YIR021W 1092 nt5.9□□□□□ -1.46
DDI1P40087 DID2YKR035W-A 615 nt5.9□□□□□ -1.46
DDI1P40087 IDP3YNL009W 1263 nt5.9□□□□□ -1.46
DDI1P40087 MBF1YOR298C-A 456 nt5.9□□□□□ -1.46
DDI1P40087 CST26YBR042C 1194 nt5.9□□□□□ -1.46
DDI1P40087 YBR226CYBR226C 411 nt5.9□□□□□ -1.46
DDI1P40087 IVY1YDR229W 1362 nt5.9□□□□□ -1.47
DDI1P40087 XBP1YIL101C 1944 nt5.89□□□□□ -1.47
DDI1P40087 MRC1YCL061C 3291 nt5.89□□□□□ -1.47
DDI1P40087 YHL017WYHL017W 1599 nt5.89□□□□□ -1.47
DDI1P40087 MDE1YJR024C 735 nt5.89□□□□□ -1.47
DDI1P40087 KTR1YOR099W 1182 nt5.89□□□□□ -1.47
DDI1P40087 FIT2YOR382W 462 nt5.89□□□□□ -1.47
DDI1P40087 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt5.88□□□□□ -1.47
DDI1P40087 MRPS12YNR036C 462 nt5.88□□□□□ -1.47
DDI1P40087 YBR124WYBR124W 360 nt5.88□□□□□ -1.47
DDI1P40087 PRP24YMR268C 1335 nt5.88□□□□□ -1.47
DDI1P40087 HRQ1YDR291W 3234 nt5.88□□□□□ -1.47
DDI1P40087 RRP46YGR095C 672 nt5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.3 ms