Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP6V1E1P36543 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP6V1E1P36543 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP6V1E1P36543 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP6V1E1P36543 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP6V1E1P36543 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP6V1E1P36543 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP6V1E1P36543 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP6V1E1P36543 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP6V1E1P36543 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP6V1E1P36543 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP6V1E1P36543 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP6V1E1P36543 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP6V1E1P36543 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP6V1E1P36543 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP6V1E1P36543 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP6V1E1P36543 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP6V1E1P36543 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP6V1E1P36543 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP6V1E1P36543 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP6V1E1P36543 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP6V1E1P36543 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP6V1E1P36543 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP6V1E1P36543 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP6V1E1P36543 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP6V1E1P36543 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP6V1E1P36543 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP6V1E1P36543 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP6V1E1P36543 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP6V1E1P36543 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP6V1E1P36543 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP6V1E1P36543 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP6V1E1P36543 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP6V1E1P36543 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP6V1E1P36543 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP6V1E1P36543 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP6V1E1P36543 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP6V1E1P36543 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP6V1E1P36543 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP6V1E1P36543 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP6V1E1P36543 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP6V1E1P36543 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP6V1E1P36543 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATP6V1E1P36543 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATP6V1E1P36543 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATP6V1E1P36543 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP6V1E1P36543 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP6V1E1P36543 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP6V1E1P36543 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP6V1E1P36543 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP6V1E1P36543 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP6V1E1P36543 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP6V1E1P36543 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP6V1E1P36543 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP6V1E1P36543 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP6V1E1P36543 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP6V1E1P36543 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP6V1E1P36543 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP6V1E1P36543 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP6V1E1P36543 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP6V1E1P36543 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP6V1E1P36543 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP6V1E1P36543 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP6V1E1P36543 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP6V1E1P36543 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP6V1E1P36543 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP6V1E1P36543 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP6V1E1P36543 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP6V1E1P36543 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP6V1E1P36543 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP6V1E1P36543 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP6V1E1P36543 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP6V1E1P36543 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP6V1E1P36543 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP6V1E1P36543 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP6V1E1P36543 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP6V1E1P36543 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP6V1E1P36543 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP6V1E1P36543 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP6V1E1P36543 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP6V1E1P36543 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP6V1E1P36543 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP6V1E1P36543 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP6V1E1P36543 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP6V1E1P36543 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP6V1E1P36543 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP6V1E1P36543 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP6V1E1P36543 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP6V1E1P36543 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP6V1E1P36543 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP6V1E1P36543 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP6V1E1P36543 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP6V1E1P36543 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP6V1E1P36543 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP6V1E1P36543 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP6V1E1P36543 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP6V1E1P36543 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP6V1E1P36543 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP6V1E1P36543 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP6V1E1P36543 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.2 ms