Protein–RNA interactions for Protein: P28476

GABRR2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-2, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR2P28476 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GABRR2P28476 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GABRR2P28476 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GABRR2P28476 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GABRR2P28476 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GABRR2P28476 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GABRR2P28476 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GABRR2P28476 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GABRR2P28476 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GABRR2P28476 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GABRR2P28476 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GABRR2P28476 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GABRR2P28476 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GABRR2P28476 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GABRR2P28476 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GABRR2P28476 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GABRR2P28476 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GABRR2P28476 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GABRR2P28476 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GABRR2P28476 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GABRR2P28476 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GABRR2P28476 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GABRR2P28476 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GABRR2P28476 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GABRR2P28476 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GABRR2P28476 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GABRR2P28476 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GABRR2P28476 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GABRR2P28476 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GABRR2P28476 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GABRR2P28476 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GABRR2P28476 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GABRR2P28476 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GABRR2P28476 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GABRR2P28476 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GABRR2P28476 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GABRR2P28476 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GABRR2P28476 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GABRR2P28476 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GABRR2P28476 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GABRR2P28476 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GABRR2P28476 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GABRR2P28476 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GABRR2P28476 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GABRR2P28476 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GABRR2P28476 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GABRR2P28476 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GABRR2P28476 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GABRR2P28476 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GABRR2P28476 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GABRR2P28476 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GABRR2P28476 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GABRR2P28476 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GABRR2P28476 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GABRR2P28476 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GABRR2P28476 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GABRR2P28476 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GABRR2P28476 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GABRR2P28476 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GABRR2P28476 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GABRR2P28476 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GABRR2P28476 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GABRR2P28476 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GABRR2P28476 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GABRR2P28476 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GABRR2P28476 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GABRR2P28476 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GABRR2P28476 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GABRR2P28476 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GABRR2P28476 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GABRR2P28476 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GABRR2P28476 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GABRR2P28476 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABRR2P28476 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GABRR2P28476 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABRR2P28476 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GABRR2P28476 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GABRR2P28476 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GABRR2P28476 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GABRR2P28476 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GABRR2P28476 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GABRR2P28476 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GABRR2P28476 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GABRR2P28476 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GABRR2P28476 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GABRR2P28476 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GABRR2P28476 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GABRR2P28476 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GABRR2P28476 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GABRR2P28476 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GABRR2P28476 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GABRR2P28476 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GABRR2P28476 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GABRR2P28476 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GABRR2P28476 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GABRR2P28476 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GABRR2P28476 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GABRR2P28476 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GABRR2P28476 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GABRR2P28476 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 222.7 ms