Protein–RNA interactions for Protein: P21439

ABCB4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB4P21439 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCB4P21439 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCB4P21439 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCB4P21439 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCB4P21439 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCB4P21439 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCB4P21439 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCB4P21439 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCB4P21439 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCB4P21439 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCB4P21439 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCB4P21439 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCB4P21439 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCB4P21439 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCB4P21439 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCB4P21439 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCB4P21439 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCB4P21439 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCB4P21439 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCB4P21439 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCB4P21439 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCB4P21439 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCB4P21439 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCB4P21439 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCB4P21439 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCB4P21439 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCB4P21439 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ABCB4P21439 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ABCB4P21439 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ABCB4P21439 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ABCB4P21439 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ABCB4P21439 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ABCB4P21439 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ABCB4P21439 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ABCB4P21439 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ABCB4P21439 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ABCB4P21439 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ABCB4P21439 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ABCB4P21439 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCB4P21439 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCB4P21439 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCB4P21439 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCB4P21439 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCB4P21439 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCB4P21439 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCB4P21439 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCB4P21439 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCB4P21439 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCB4P21439 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCB4P21439 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCB4P21439 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCB4P21439 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCB4P21439 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCB4P21439 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCB4P21439 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCB4P21439 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCB4P21439 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCB4P21439 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCB4P21439 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCB4P21439 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCB4P21439 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCB4P21439 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCB4P21439 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ABCB4P21439 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ABCB4P21439 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ABCB4P21439 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ABCB4P21439 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ABCB4P21439 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ABCB4P21439 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ABCB4P21439 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ABCB4P21439 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ABCB4P21439 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ABCB4P21439 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ABCB4P21439 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCB4P21439 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCB4P21439 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCB4P21439 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCB4P21439 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCB4P21439 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCB4P21439 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCB4P21439 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ABCB4P21439 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ABCB4P21439 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ABCB4P21439 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ABCB4P21439 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCB4P21439 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCB4P21439 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCB4P21439 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCB4P21439 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCB4P21439 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCB4P21439 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ABCB4P21439 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ABCB4P21439 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ABCB4P21439 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ABCB4P21439 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ABCB4P21439 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ABCB4P21439 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ABCB4P21439 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ABCB4P21439 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ABCB4P21439 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms