Protein–RNA interactions for Protein: P13473

LAMP2, Lysosome-associated membrane glycoprotein 2, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP2P13473 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMP2P13473 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMP2P13473 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMP2P13473 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMP2P13473 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMP2P13473 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMP2P13473 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMP2P13473 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMP2P13473 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMP2P13473 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMP2P13473 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMP2P13473 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMP2P13473 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMP2P13473 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMP2P13473 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMP2P13473 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMP2P13473 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMP2P13473 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMP2P13473 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMP2P13473 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMP2P13473 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMP2P13473 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMP2P13473 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMP2P13473 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMP2P13473 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMP2P13473 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMP2P13473 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMP2P13473 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMP2P13473 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMP2P13473 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMP2P13473 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMP2P13473 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMP2P13473 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMP2P13473 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMP2P13473 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMP2P13473 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMP2P13473 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMP2P13473 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMP2P13473 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMP2P13473 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMP2P13473 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMP2P13473 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMP2P13473 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LAMP2P13473 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LAMP2P13473 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMP2P13473 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMP2P13473 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMP2P13473 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMP2P13473 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMP2P13473 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMP2P13473 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMP2P13473 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMP2P13473 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMP2P13473 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMP2P13473 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMP2P13473 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMP2P13473 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMP2P13473 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMP2P13473 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAMP2P13473 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAMP2P13473 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAMP2P13473 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMP2P13473 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMP2P13473 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMP2P13473 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMP2P13473 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMP2P13473 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LAMP2P13473 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LAMP2P13473 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LAMP2P13473 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LAMP2P13473 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LAMP2P13473 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LAMP2P13473 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LAMP2P13473 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LAMP2P13473 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LAMP2P13473 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LAMP2P13473 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LAMP2P13473 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LAMP2P13473 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAMP2P13473 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAMP2P13473 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAMP2P13473 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAMP2P13473 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMP2P13473 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMP2P13473 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMP2P13473 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMP2P13473 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMP2P13473 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMP2P13473 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMP2P13473 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMP2P13473 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMP2P13473 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMP2P13473 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMP2P13473 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMP2P13473 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAMP2P13473 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMP2P13473 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMP2P13473 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAMP2P13473 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAMP2P13473 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms