Protein–RNA interactions for Protein: P13010

XRCC5, X-ray repair cross-complementing protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC5P13010 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
XRCC5P13010 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
XRCC5P13010 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
XRCC5P13010 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
XRCC5P13010 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
XRCC5P13010 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
XRCC5P13010 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
XRCC5P13010 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
XRCC5P13010 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
XRCC5P13010 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
XRCC5P13010 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
XRCC5P13010 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
XRCC5P13010 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
XRCC5P13010 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
XRCC5P13010 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
XRCC5P13010 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
XRCC5P13010 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
XRCC5P13010 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
XRCC5P13010 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
XRCC5P13010 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
XRCC5P13010 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
XRCC5P13010 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
XRCC5P13010 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
XRCC5P13010 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
XRCC5P13010 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
XRCC5P13010 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
XRCC5P13010 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
XRCC5P13010 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
XRCC5P13010 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
XRCC5P13010 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
XRCC5P13010 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
XRCC5P13010 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
XRCC5P13010 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
XRCC5P13010 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
XRCC5P13010 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
XRCC5P13010 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
XRCC5P13010 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
XRCC5P13010 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
XRCC5P13010 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
XRCC5P13010 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
XRCC5P13010 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
XRCC5P13010 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
XRCC5P13010 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
XRCC5P13010 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
XRCC5P13010 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
XRCC5P13010 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
XRCC5P13010 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
XRCC5P13010 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
XRCC5P13010 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
XRCC5P13010 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
XRCC5P13010 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
XRCC5P13010 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
XRCC5P13010 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
XRCC5P13010 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
XRCC5P13010 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
XRCC5P13010 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
XRCC5P13010 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
XRCC5P13010 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
XRCC5P13010 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
XRCC5P13010 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
XRCC5P13010 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
XRCC5P13010 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
XRCC5P13010 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
XRCC5P13010 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
XRCC5P13010 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
XRCC5P13010 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
XRCC5P13010 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
XRCC5P13010 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
XRCC5P13010 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
XRCC5P13010 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
XRCC5P13010 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
XRCC5P13010 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
XRCC5P13010 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
XRCC5P13010 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
XRCC5P13010 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
XRCC5P13010 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
XRCC5P13010 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
XRCC5P13010 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
XRCC5P13010 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
XRCC5P13010 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
XRCC5P13010 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
XRCC5P13010 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
XRCC5P13010 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
XRCC5P13010 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
XRCC5P13010 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
XRCC5P13010 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
XRCC5P13010 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
XRCC5P13010 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
XRCC5P13010 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
XRCC5P13010 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
XRCC5P13010 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
XRCC5P13010 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
XRCC5P13010 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
XRCC5P13010 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
XRCC5P13010 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
XRCC5P13010 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
XRCC5P13010 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
XRCC5P13010 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
XRCC5P13010 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
XRCC5P13010 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms